[发明专利]一种急性髓细胞样白血病预后风险模型的构建及诊断设备有效
申请号: | 202110680914.7 | 申请日: | 2021-06-18 |
公开(公告)号: | CN113345592B | 公开(公告)日: | 2022-08-23 |
发明(设计)人: | 郭祥瑞;高洁;官士兵 | 申请(专利权)人: | 山东第一医科大学附属省立医院(山东省立医院) |
主分类号: | G16H50/50 | 分类号: | G16H50/50 |
代理公司: | 北京预立生科知识产权代理有限公司 11736 | 代理人: | 李红伟;孟祥斌 |
地址: | 250021 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 急性 细胞 白血病 预后 风险 模型 构建 诊断 设备 | ||
1.一种急性髓细胞样白血病预后风险模型的构建方法,包括:
获取缺氧相关基因;
获取急性髓细胞样白血病基因表达数据作为训练数据集;
利用回归模型或机器学习,在训练数据集中,对所述缺氧相关基因进行特征选择,得到预后风险相关基因,所述利用回归模型是通过单因素COX回归模型对所述缺氧相关基因进行特征选择,得到预后风险相关基因,所述预后风险相关基因为EGFR、PYGM和GPC3基因;
利用所述预后风险相关基因,采用LASSOCOX回归分析或多因素COX回归分析,构建急性髓细胞样白血病预后风险模型;
将所述构建急性髓细胞样白血病预后风险模型作为特征向量,选取临床病理特征,利用所述特征向量和临床病理特征构建急性髓细胞样白血病预后综合风险模型。
2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,获取缺氧相关基因还包括如下处理:通过蛋白质相互网络、基因共表达网络、转录因子调控网络、pathway网络中的一种或几种基于网络分析方法筛选出排名靠前的缺氧相关基因。
3.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述获取缺氧相关基因是获取GSEA数据库中缺氧相关基因。
4.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,通过PPI网络分析方法筛选出排名靠前的缺氧相关基因。
5.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述选取临床病理特征包括:采用回归模型或机器学习筛选出与急性髓细胞样白血病生存相关的临床病理特征。
6.一种急性髓细胞样白血病预后风险诊断设备,所述设备包括:存储器和处理器;
所述存储器用于存储程序指令;
所述处理器用于调用程序指令,当程序指令被执行时,用于执行以下操作:
获取待测样本的基因表达数据及临床病理特征;
将所述待测样本的基因表达数据及临床病理特征输入权利要求1-5任意一项所述的急性髓细胞样白血病预后综合风险模型中;
获得待测样本急性髓细胞样白血病预后风险预测结果。
7.一种急性髓细胞样白血病预后风险诊断设备,所述设备包括:存储器和处理器;
所述存储器用于存储程序指令;
所述处理器用于调用程序指令,当程序指令被执行时,用于执行以下操作:
获取待测样本的基因表达数据;
将所述待测样本的基因表达数据输入权利要求1-5任意一项所述的急性髓细胞样白血病预后风险模型中;
获得待测样本急性髓细胞样白血病预后风险预测结果。
8.一种急性髓细胞样白血病预后风险诊断设备,所述设备包括:存储器和处理器,所述存储器用于存储程序指令;
所述处理器用于调用程序指令,当程序指令被执行时,用于执行以下操作:
获取待测样本的EGFR、PYGM和GPC3基因表达数据;
将所述EGFR、PYGM和GPC3基因表达数据输入权利要求1-5任意一项所述的急性髓细胞样白血病预后风险模型中,获得待测样本急性髓细胞样白血病预后风险预测结果。
9.一种急性髓细胞样白血病预后风险诊断设备,所述设备包括:存储器和处理器,所述存储器用于存储程序指令;
所述处理器用于调用程序指令,当程序指令被执行时,用于执行以下操作:
获取待测样本的EGFR、PYGM和GPC3基因表达数据和临床病理特征;
将所述EGFR、PYGM和GPC3基因表达情况和临床病理特征输入权利要求1-5任意一项所述的急性髓细胞样白血病预后综合风险模型中,获得待测样本急性髓细胞样白血病预后风险预测结果。
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