[发明专利]一种基于代谢组学标志物推断水中尸体早期死后淹没时间的方法及其应用有效
申请号: | 202110676551.X | 申请日: | 2021-06-18 |
公开(公告)号: | CN113341043B | 公开(公告)日: | 2022-11-25 |
发明(设计)人: | 官大威;张富源;王林林;赵锐 | 申请(专利权)人: | 中国医科大学 |
主分类号: | G01N30/06 | 分类号: | G01N30/06;G01N30/88;G01N30/86 |
代理公司: | 沈阳亚泰专利商标代理有限公司 21107 | 代理人: | 马维骏 |
地址: | 110122 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 代谢 标志 推断 水中 尸体 早期 淹没 时间 方法 及其 应用 | ||
1.一种用于推断水中尸体早期死后淹没时间的标志物的筛选方法,其特征在于,所述筛选方法的具体步骤包括:
步骤1、于0h、6h、12h、18h及24h提取溺死组大鼠和死后抛尸入水组大鼠尸体的心血,随机分为训练集和测试集;
步骤2、将每个分析样本采用UHPLC-MS/MS进行代谢组学分析,得到心血中提取的代谢物的原始代谢指纹图谱;
步骤3、将训练集代谢组学检测数据导入R语言version 3.6.1中,借助randomForest包,以样本死后淹没时间为因变量,以各种代谢物为自变量,有放回地随机抽取训练集样本建立随机森林回归模型,最终得到模型的预测精度以及以IncNodePure为代谢物相对重要程度评估指标得到各自变量的相对重要程度排序;
步骤4、对随机森林回归模型进行交叉检验,以步骤3中建立的基于全部代谢物构建的回归模型误差为参考,以相同的回归模型误差为标准建立包含更少代谢物的模型的极简回归模型;
步骤5、为建立极简模型,根据各代谢物的相对重要程度,挑选并确定了19种对推断水中尸体早期死后淹没时间具有重要作用的标志物;
所述标志物为:肾上腺素、顺乌头酸、柠檬酸、1,2,3-环丙烷三羧酸、核黄素、柠康酸、4-乙酰丁酸、D-氨基葡萄糖6-磷酸、磷酸烯醇式丙酮酸、1-甲基腺苷、3-磷酸甘油酸、肌酸、肌肽、丙酮酸、β-丙氨酸、1,5-二氨基戊烷、泛酸、尿囊素及2-二甲氨基鸟苷。
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