[发明专利]一种与Aβ诱导构建的AD细胞模型相关的生物标志物的筛选与应用有效

专利信息
申请号: 202110676533.1 申请日: 2021-06-18
公开(公告)号: CN113341042B 公开(公告)日: 2022-11-04
发明(设计)人: 张林;方德宇;张晓丽;柳春;赵丹玉;王艳杰;陈文娜;郭隽馥;丛培玮;谷丽艳;殷晓梅;倪菲;李硕;苗君静;宋丹君;朱昱林;郭星池 申请(专利权)人: 辽宁中医药大学
主分类号: G01N30/06 分类号: G01N30/06;G01N30/88
代理公司: 沈阳亚泰专利商标代理有限公司 21107 代理人: 马维骏
地址: 110847 辽*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 一种 诱导 构建 ad 细胞 模型 相关 生物 标志 筛选 应用
【权利要求书】:

1.一种与Aβ诱导构建的AD细胞模型相关的生物标志物的应用,其特征在于,所述应用包括用于检测Aβ1-42寡聚体诱导SH-SY5Y细胞构建AD细胞模型是否成功,所述标志物包括如下完整蛋白:

蛋白名称为Cysteine desulfurase,mitochondrial,编码基因为NFS1、蛋白名称为NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9,mitochondrial,编码基因为NDUFA9、蛋白名称为3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2,编码基因为HSD17B10、蛋白名称为Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4,编码基因为NDUFA4、蛋白名称为NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit,mitochondrial,编码基因为NDUFS1、蛋白名称为Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit,mitochondrial,编码基因为SDHB、蛋白名称为NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4,mitochondrial,编码基因为NDUFS4、蛋白名称为Lipoprotein lipase,编码基因为LPL以及蛋白名称为NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplexsubunit 5,编码基因为NDUFA5;

与正常对照组相比,AD细胞模型中,Cysteine desulfurase,mitochondrial、NADHdehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9,mitochondrial、3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2、Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4、NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit,mitochondrial、Succinatedehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit,mitochondrial、NADHdehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4,mitochondrial以及Lipoproteinlipase上调,NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5下调;

所述生物标志物的蛋白质氨基酸序列分别如SEQ ID NO.1~ SEQ ID NO.9所示;

所述AD为阿尔茨海默病。

2.根据权利要求1所述一种与Aβ诱导构建的AD细胞模型相关的生物标志物的应用,其特征在于,所述应用还包括用于制备检测Aβ诱导AD细胞模型的试剂盒。

3.如权利要求1所述的一种与Aβ诱导构建的AD细胞模型相关的生物标志物的应用,其特征在于,其中相关生物标志物的筛选方法包括如下步骤:(1)构建Aβ诱导的AD细胞;(2)蛋白质提取;(3)蛋白质定量;(4)蛋白质酶解;(5)LC-MS/MS 分析;(6)数据库检索;(7)生物信息学分析。

4.根据权利要求3所述的一种与Aβ诱导构建的AD细胞模型相关的生物标志物的应用,其特征在于,步骤(6)中,数据库为:Uniprot-Homo sapiens Human-173343-20191013.fasta,物种:人。

5.根据权利要求3所述的一种与Aβ诱导构建的AD细胞模型相关的生物标志物的应用,其特征在于,步骤(7)中,生物信息学分析包括:差异蛋白质的Gene Ontology富集分析、差异蛋白质显著性功能分析、差异蛋白KEGG通路分析以及蛋白质相互作用分析。

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