[发明专利]VDAC1突变基因、检测其的引物、试剂盒和方法以及其用途

说明书

本发明涉及与LIMD相关的VDAC1突变基因、检测其的引物、试剂盒和方法以及其用途，突变VDAC1基因与人类基因组参考序列GRCh37相比具有以下突变中的一种：5号染色体物理位置为133326788的碱基由C突变为A、5号染色体物理位置为133316511的碱基由G突变为A；突变VDAC1基因的cDNA序列与SEQ ID NO.1的序列相比具有如下突变中的一种：c.175GT、c.460CT；突变VDAC1蛋白的序列与SEQ ID NO.2的序列相比具有以下突变中的一种：p.Glu59Ter、p.Gln154Ter。本发明为LIMD的早期分子筛查、家族遗传研究提供了重要的依据。

技术领域

本发明涉及疾病相关突变基因，具体涉及VDAC1突变基因、检测其的引物、试剂盒和方法以及其用途。

背景技术

在所有遗传性代谢疾病中，线粒体疾病的发病率最高。线粒体主要负责氧化磷酸化产生三磷酸腺苷。线粒体疾病的发病机制涉及两种不同的基因组：核基因组和母体遗传的16.6kb线粒体基因组。线粒体疾病可由这些基因组中的任何一个突变引起的。核DNA(nDNA)的缺陷会导致诸如呼吸链复杂结构、翻译和线粒体DNA(mtDNA)修复缺陷等问题。在儿童时期诊断的线粒体疾病中，大约25％是由于线粒体DNA异常引起的，而其余75％是由于nDNA缺陷引起的。严重的新生儿或婴儿起病的线粒体疾病通常会导致出生后一年内死亡，婴儿致死性线粒体疾病(lethal infantile mitochondrial disease,LIMD)约占儿童期起病线粒体疾病病例的8.5％，但LIMD的分子遗传诊断率很低，大多数LIMD病例是在受试者死亡后通过生物化学和遗传方法才得到诊断。因此，当父母再次怀孕时，这类新生儿发病的严重线粒体疾病由于诊断不及时，还有可能再次发生。虽然已发现近千种核基因组基因与线粒体的功能有关，仅仅有少部分确定与LIMD的发生有关，提示存在新的LIMD致病基因有待挖掘。

发明内容

本发明的目的在于提供一种与婴儿致死性线粒体疾病有关的VDAC1突变基因、检测其的引物、试剂盒和方法以及其用途。

本发明的目的通过如下技术方案实现：

一种突变VDAC1基因或突变VDAC1蛋白，所述突变VDAC1基因与人类基因组参考序列GRCh37相比具有以下突变中的至少一种：

5号染色体物理位置为133326788的碱基由C突变为A、5号染色体物理位置为133316511的碱基由G突变为A；

所述突变VDAC1基因的cDNA序列与SEQ ID NO.1的序列相比具有如下突变中的至少一种：

c.175GT、c.460CT；

所述突变VDAC1蛋白的序列与SEQ ID NO.2的序列相比具有以下突变中的至少一种：

p.Glu59Ter(59位谷氨酸突变为终止密码子)、p.Gln154Ter(154位谷氨酰胺突变为终止密码子)。

VOLTAGE-DEPENDENT ANION CHANNEL 1(电压依赖性阴离子通道1，VDAC1)基因位于5号染色体5q31.1位置，该基因含有9个外显子，其编码的VDAC1蛋白有283个氨基酸，分子量约为31KDa。VDAC1是线粒体外膜和细胞膜的通道分子。该通道允许亲水小分子扩散通过线粒体外膜；在细胞膜中，它参与细胞体积调节和细胞凋亡。VDAC1可以结合各种信号分子，包括鞘脂神经酰胺、磷脂磷脂酰胆碱和固醇胆固醇。在去极化线粒体中，作用于PRKN和PINK1的下游，促进线粒体吞噬或防止细胞凋亡。VDAC1参与通透性过渡孔复合体(PTPC)的形成，该复合物负责释放引发细胞凋亡的线粒体产物，VDAC1介导ATP从细胞的输出。目前VDAC1与疾病的相关性未见报道。