[发明专利]一种用于鉴定香菇同一菌株不同单核体交配型A的InDel分子标记及方法

说明书

本发明公开一种用于鉴定香菇同一菌株不同单核体交配型A的InDel分子标记及方法，所述InDel分子标记的碱基序列选自：SEQ ID NO.1；鉴定香菇同一菌株不同单核体交配型A的方法包括以下步骤：S1、获取香菇的DNA；S2、PCR扩增香菇的DNA；S3、PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳；S4、根据电泳条带的数量和长度判断香菇的交配型；本发明提供的InDel位点和引物为香菇A交配型鉴定提供了一种新方法。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体是一种用于鉴定香菇同一菌株不同单核体交配型A的 InDel分子标记、引物组合物、试剂盒及方法。

背景技术

香菇作为最重要的栽培食用菌，对其交配型多态性的研究一直受到遗传育种学者的高度重视。香菇属于四级性异宗结合食用菌，A位点上的交配型基因控制锁状细胞的形成、双核的配对、双核的同步分裂、锁状细胞与顶端细胞间隔膜的形成。B位点上的交配型基因控制核的迁移、细胞隔膜的融解、锁状细胞与次顶端细胞的融合。现有报道，中国香菇自然群体中据测算存在121种A特异型和151种B特异型，可以产生18000多种交配型。

交配型和交配型相关基因的研究是揭示真菌有性生殖机制的关键。交配型基因位点的解析有利于了解异宗配合真菌的性亲和系统作用机制，也是食用菌遗传育种、菌种改良的基础。早期研究认为不同的MAT基因来源于染色体上同一DNA保守区，这些区域发生定向或非定向突变，导致不同交配方式的产生，因此同宗配合和异宗配合为共同起源。近年来，在基因组测序的基础上，担子菌中对香菇、草菇、灵芝、金针菇等交配型位点的研究不断取得进展，交配型位点被发现和鉴定以来，科学家进行了大量的研究，明确了其中一些基础性的问题，如MAT基因与交配型控制、MAT基因的信号通路及上下游基因等。因此，进一步围绕交配型基因开展有性生殖机制的深入研究，在不同的真菌中分析交配型基因的结构、功能和亲缘关系，对担子菌生长发育和遗传进化的研究仍具有重要的意义。

此外，交配型基因能够控制食用菌杂交和有性繁殖过程，全面和深入了解交配型系统的分子遗传学结构并开发有效鉴定交配型的分子标记，将有助于我们解决食用菌产业发展中的育种相关科学问题。香菇目前最常用的新品种选育手段是杂交育种，而单核体是香菇杂交育种和进行遗传学研究的重要中间材料。单核体的鉴定通常采用显微镜检确认是否存在锁状联合来判断，而鉴定单核体的交配型则需要进行大量的配对和显微镜检工作，且工作量随着单核群体数量的增加而增加，多轮交配通常需耗时2个月左右，并且容易发生人为因素误检。

综上所述，目前还缺少一种用于鉴定香菇同一菌株不同单核体交配型A快速、准确、高效鉴定的技术手段。

发明内容

本发明提供一种用于鉴定香菇同一菌株不同单核体交配型A快速、准确、高效鉴定的 InDel分子标记、引物组合物、试剂盒及方法。

为达此目的，本发明提供如下的技术方案：

本发明的第一个方面，提供了一种用于鉴定香菇同一菌株不同单核体交配型A的InDel 分子标记，所述InDel分子标记的碱基序列选自：SEQ ID NO.1。

SEQ ID NO.1：AGTAGAAGTCGTAGT。

优选的，所述香菇包括申香8号、申香10号、申香12号、申香215、香杂26、菌兴8 号、N5、N6、241-4、武香1号、闽丰1号、沪香F2、金地香菇、庆元9015、Q1、931、L26、 L808、Jang808、868、王Japan、香菇Cr02、Cr04、Cr62、华香8号、赣香1号、香如、浙香6号、0912、212、3176、L135、苏香、L952。

本发明的第二个方面，提供了一种用于鉴定香菇同一菌株不同单核体交配型A的引物组合物，所述引物组合物包括：

扩增SEQ ID NO.1的引物：

SEQ ID NO.2：5’-GTGAAGAGTAACACGGTGAG-3’