[发明专利]一种染色体变异检测方法、装置、电子设备及介质有效

专利信息
申请号: 202110620219.1 申请日: 2021-06-03
公开(公告)号: CN113192557B 公开(公告)日: 2022-01-25
发明(设计)人: 陈河兵;杨骞;李昊;伯晓晨 申请(专利权)人: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
主分类号: G16B20/20 分类号: G16B20/20;G16B30/00;G16B40/00
代理公司: 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 代理人: 田云
地址: 100850 *** 国省代码: 北京;11
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 染色体 变异 检测 方法 装置 电子设备 介质
【权利要求书】:

1.一种染色体变异检测方法,其特征在于,所述方法包括:

获取待检测染色体的初始测序数据;

根据所述初始测序数据的分辨率,构造所述初始测序数据的特征谱;其中,所述特征谱表征了所述初始测序数据对应的不同强度信号的分布情况;

根据所述初始测序数据的特征谱,统计各个待检测染色体的第一离群量和第一特征向量;

从所述待检测染色体中,选择第一离群量大于第一预设阈值的染色体,并确定为发生变异染色体;

根据所述发生变异染色体对应的第一特征向量,确定所述发生变异染色体的变异位置;

所述根据所述初始测序数据的分辨率,构造所述初始测序数据的特征谱,包括:

基于初始测序数据中每一个序列数据的不同分辨率,将所述初始测序数据转化为多个表征染色体片段间的交互频率的测序互作矩阵;

计算每个所述测序互作矩阵的特征值;

根据多个测序互作矩阵分别对应的特征值,构造所述初始测序数据的特征谱。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述初始测序数据的特征谱,统计各个待检测染色体的第一离群量,包括:

计算所述特征谱的直方统计区间;

根据所述直方统计区间,统计各个待检测染色体的第一离群量。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述初始测序数据的特征谱,统计各个待检测染色体的第一特征向量,包括:

构建第一离群量中各个离群值的第二特征向量;

基于所述第二特征向量,按照各个待检测染色体分辨率位置取平均值,确定为所述各个待检测染色体的第一特征向量。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第一预设阈值通过如下方式确定,包括:

获取待检测染色体的参考测序数据;

统计所述参考测序数据的第二离群量;

从所述第二离群量中,统计相关性大于第二预设阈值的第三离群量,作为第一预设阈值。

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述根据所述发生变异染色体对应的第一特征向量,确定所述发生变异染色体的变异位置,包括:

计算所述参考测序数据的第二特征向量;

根据所述发生变异染色体对应的第一特征向量与所述第二特征向量的峰值位置,确定所述发生变异染色体的变异位置。

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述计算所述参考测序数据的第二特征向量,包括:

构建第二离群量中各个离群值的第三特征向量;

基于所述第三特征向量,按照各个参考染色体分辨率位置取平均值,确定为所述各个待检测染色体的第二特征向量。

7.一种染色体变异检测装置,其特征在于,所述装置包括:

获取模块,用于获取待检测染色体的初始测序数据;

构造模块,用于根据所述初始测序数据的分辨率,构造所述初始测序数据的特征谱;其中,所述特征谱表征了所述初始测序数据对应的不同强度信号的分布情况;

统计模块,用于根据所述初始测序数据的特征谱,统计各个待检测染色体的第一离群量和第一特征向量;

选择模块,用于从所述待检测染色体中,选择第一离群量大于第一预设阈值的染色体,并确定为发生变异染色体;

确定模块,用于根据所述发生变异染色体对应的第一特征向量,确定所述发生变异染色体的变异位置;

所述构造模块,在用于根据所述初始测序数据的分辨率,构造所述初始测序数据的特征谱时,包括:

所述根据所述初始测序数据的分辨率,构造所述初始测序数据的特征谱,包括:

基于初始测序数据中每一个序列数据的不同分辨率,将所述初始测序数据转化为多个表征染色体片段间的交互频率的测序互作矩阵;

计算每个所述测序互作矩阵的特征值;

根据多个测序互作矩阵分别对应的特征值,构造所述初始测序数据的特征谱。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国人民解放军军事科学院军事医学研究院,未经中国人民解放军军事科学院军事医学研究院许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202110620219.1/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

同类专利
专利分类
×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top