[发明专利]鸡RIN2基因的61-bp indel多态性在预示和鉴定鸡腹脂肪性状方面的应用

说明书

本发明涉及鸡RIN2基因NC_052534.1:g.4350067‑4350127位61‑bp indel多态性在预示和鉴定鸡腹脂性状方面的应用。61‑bp indel多态性作为分子标记能有效预示和鉴定鸡腹脂性状，包括鸡脂肪带宽、腹脂重和腹脂率。该分子标记采用琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物的方法进行基因分型，操作简便、成本较低。

技术领域

本发明属于分子遗传学技术领域，具体涉及鸡RIN2基因NC_052534.1:g.4350067-4350127位61-bp indel多态性在预示和鉴定鸡腹脂肪性状方面的应用。

背景技术

肉鸡是人类最普遍饲养的家禽，随着育种人员对肉鸡生长速率选择，在提高肉鸡的生产性能的同时，也造成一些生理不适应症等问题，比如体脂含量过高、猝死症、腹水综合症等负面效应。其中体脂含量过高的问题是育种学家面临的一个难题，过度沉积的脂肪并不是家禽自身生理所需要的，大多数脂肪在屠宰时候会被直接丢弃，直接影响肉产品的质量，降低屠宰率和经济效益。

影响肉鸡的脂肪沉积主要因素有遗传、营养、环境因素，而从长期的效益来看，解决脂肪过度沉积最有效的方法是遗传手段。近年来，随着分子遗传学的迅速发展，遗传标记慢慢被应用于畜禽的标记辅助选择，此项技术可显著提高育种效率和准确率。

比如中国发明专利，公开号为CN108841932B，其公开了一种预示和鉴定鸡腹部脂肪量的分子标记方法及应用，其根据PCSK1基因的单核苷酸多态性来预示和鉴定鸡腹部脂肪量。但是其提供的方法比较复杂，根据所得引物进行鸡基因组DNA的PCR扩增，之后利用限制性酶对扩增产物进行酶切，再电泳分离以获得鸡腹脂标记基因型。

发明内容

本发明要解决的技术问题是为预示和鉴定鸡腹脂肪性状提供一种可供应用的分子标记。本发明的NC_052534.1:g.4350067-4350127位61-bp indel多态性的基因分型能有效预示和鉴定鸡腹脂肪性状，包括鸡脂肪带宽、腹脂重和腹脂率。该分子标记采用琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物的方法进行基因分型，操作简便、成本较低。

本发明的目的是提供鸡RIN2基因NC_052534.1:g.4350067-4350127位61-bpindel多态性在预示和鉴定鸡腹脂肪性状方面的应用。

本发明的另一目的是提供一种鸡RIN2基因NC_052534.1:g.4350067-4350127位61-bp indel多态性的检测方法及其在鸡遗传育种方面的应用。

本发明的另一目的是提供一种检测鸡RIN2基因NC_052534.1:g.4350067-4350127位61-bp indel多态性的引物组。

为实现上述目的，本发明提供如下技术方案：

鸡RIN2基因NC_052534.1:g.4350067-4350127位61-bp indel多态性在预示和鉴定鸡脂肪性状方面的应用。

具体地，所述的鸡腹脂肪性状为鸡脂肪带宽、腹脂重和腹脂率。

一种鸡RIN2基因NC_052534.1:g.4350067-4350127位61-bp indel多态性的检测方法，根据鸡RIN2基因NC_052534.1:g.4350067-4350127位上下游序列设计PCR扩增引物，再根据所得引物进行鸡基因组DNA的PCR扩增，扩增结果：

纯合子插入基因型在琼脂糖凝胶电泳中表现为646bp的单条带；

纯合子缺失基因型在琼脂糖凝胶电泳中表现为585bp的单条带；

杂合子插入/缺失基因型在琼脂糖凝胶电泳中表现为646bp和585bp两条分子量不同的条带。

其中，优选地，所述的PCR扩增引物为：