[发明专利]一种意大利蜜蜂体色分化相关基因的检测及其应用在审
申请号: | 202110608609.7 | 申请日: | 2021-06-01 |
公开(公告)号: | CN113512594A | 公开(公告)日: | 2021-10-19 |
发明(设计)人: | 舒蕊;代君君;刘健;赵萍;刘震 | 申请(专利权)人: | 安徽省农业科学院蚕桑研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 合肥汇融专利代理有限公司 34141 | 代理人: | 陈维琴 |
地址: | 230000*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 意大利 蜜蜂 分化 相关 基因 检测 及其 应用 | ||
1.一种意大利蜜蜂体色分化相关基因的检测及其应用,其特征在于,所述检测的相关基因为意大利蜜蜂蝶呤-4-α-甲醇胺脱水酶的基因,检测的方法为设计一组荧光定量引物进行检测,其引物序列为:
Amel-PCD-QRT-F:CTGTGCAACAAGATAGAG;
Amel-PCD-QRT-R:CATTAACATCGTGAGAAG。
2.根据权利要求1所述的一种意大利蜜蜂体色分化相关基因的检测及其应用,其特征在于:所述检测方法包括以下步骤:
(1)荧光定量引物的设计:采用NCBI预测该基因信息,获得基因序列为SEQ ID NO.7,后对意大利蜜蜂中的蜂王、工蜂、雄蜂中PCD进行扩增,检测得序列为SEQ ID NO.8,以二者共同的部分为模板设计荧光定量引物得:
Amel-PCD-QRT-F:CTGTGCAACAAGATAGAG;
Amel-PCD-QRT-R:CATTAACATCGTGAGAAG;
(2)总RNA的提取:采用任意一种通用的RNA提取方法,从意大利蜜蜂成体中提取总RNA,总RNA序列如SEQ ID NO.9;
(3)cDNA合成:以意大利蜜蜂总RNA为模板合成cDNA,反应体系为20μL;
(4)实时荧光PCR:以上述合成的cDNA为模板,上述步骤(1)中Amel-PCD-QRT-F和Amel-PCD-QRT-R以及β-actin-F和β-actin-R为特异性引物,进行实时荧光PCR扩增反应,每个样品设3个平行管,扩增后所得3个平行管的Ct值取平均数;
(5)意大利蜜蜂蝶呤-4-α-甲醇胺脱水酶基因相对表达量的计算:实时荧光定量PCR后,当目的基因与内参基因的扩增效率相近时,计算意大利蜜蜂工蜂、雄蜂和蜂王PCD基因的表达差。
3.根据权利要求2所述的一种意大利蜜蜂体色分化相关基因的检测及其应用,其特征在于:所述步骤(1)中选用以下引物序列进行PCD基因全长的扩增:
Amel-PCD-like-F:TATGTCGATTCTTACGCG;
Amel-PCD-like-R:TTTTCTTCCATTTTAGCAAT。
4.根据权利要求2所述的一种意大利蜜蜂体色分化相关基因的检测及其应用,其特征在于:所述步骤(4)中β-actin-F的序列为ATGCCAACACTGTCCTTTCTGG;β-actin-R的序列为GACCCACCAATCCATACGGA。
5.根据权利要求2所述的一种意大利蜜蜂体色分化相关基因的检测及其应用,其特征在于:所述操作中每条引物分别配制成浓度为100μM的贮存液,工作浓度为2μM。
6.根据权利要求2所述的一种意大利蜜蜂体色分化相关基因的检测及其应用,其特征在于:所述步骤(5)中采用2-ΔΔCT法计算PCD基因的相对表达量,并比较差异。
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