[发明专利]一种鉴定小麦叶片绒毛基因的分子标记、引物组和应用有效
申请号: | 202110607480.8 | 申请日: | 2021-06-01 |
公开(公告)号: | CN113278724B | 公开(公告)日: | 2023-06-16 |
发明(设计)人: | 刘泽厚;王琴;万洪深;杨凡;李俊;杨武云;杨宁 | 申请(专利权)人: | 四川省农业科学院作物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11;A01H1/04 |
代理公司: | 成都金英专利代理事务所(普通合伙) 51218 | 代理人: | 袁英 |
地址: | 610011 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 小麦 叶片 绒毛 基因 分子 标记 引物 应用 | ||
1.一种鉴定小麦叶片绒毛基因的分子标记,其特征在于:该基因定位在地方品种白毛麦的7BS染色体上,命名为QLP.saas-7BS;所述QLP.saas-7BS定位区间为AX-86175290和AX-86172908之间的0.48Mb区间内,所述AX-86175290的物理位置为61106266-61106336b,所述AX-86172908的物理位置为60629908-60629979b;利用QLP.saas-7BS位点侧翼SNP 探针AX-86175290和AX-86172908开发两对KASP特异连锁标记,所述连锁标记为KASP-AX-86175290的KASP标记和KASP-AX-86172908的KASP标记;所述标记KASP-AX-86175290和KASP-AX-86172908 的引物组核苷酸序列分别为,
KASP-AX-86172908引物组序列如下:
FAM:GAAGGTGACCAAGTTCATGCTTGCACAACCAGTCAGCAGAAA,
HEX:GAAGGTCGGAGTCAACGGATTTGCACAACCAGTCAGCAGAAG,
COM:TCGGGATATTGAATTCTTGAGCTAC;
KASP-AX-86175290引物组序列如下:
FAM:GAAGGTGACCAAGTTCATGCT TGCAGTGAAGTTATTAACACC,
HEX:GAAGGTCGGAGTCAACGGATT TGCAGTGAAGTTATTAACACT,
COM:ATATGCAGTACAGATCTTTCACAG。
2.根据权利要求1所述的鉴定小麦叶片绒毛基因的分子标记,其特征在于:所述QLP.saas-7BS两翼的SNP探针分别为AX-86175290和AX-86172908,所述KASP-AX-86172908和KASP-AX-86175290是分别根据AX-86175290和AX-86172908的探针序列进行设计,AX-86175290和AX-86172908的探针序列分别为,
AX-86172908: GGCTAGTGCTGTAAATGCACAACCAGTCAGCAGAA[A/G]CGTAAATGGTGTAGCTCAAGAATTCAATATCCCGA;
AX-86175290:
TCTAAATGGGAGACCTGCAGTGAAGTTATTAACAC[C/T]AACTGGAAGGACTGTGAAAGATCTGTACTGCATAT。
3.用于鉴定权利要求2所述分子标记的引物组,其特征在于,检测基因QLP.saas-7BS的KASP功能标记引物有两组,分别如下:
第一组,KASP-AX-86172908引物序列如下:
FAM: GAAGGTGACCAAGTTCATGCTTGCACAACCAGTCAGCAGAAA,
HEX:GAAGGTCGGAGTCAACGGATTTGCACAACCAGTCAGCAGAAG,
COM:TCGGGATATTGAATTCTTGAGCTAC;
第二组,KASP-AX-86175290引物序列如下:
FAM: GAAGGTGACCAAGTTCATGCT TGCAGTGAAGTTATTAACACC,
HEX:GAAGGTCGGAGTCAACGGATT TGCAGTGAAGTTATTAACACT,
COM:ATATGCAGTACAGATCTTTCACAG。
4.根据权利要求3所述的引物组,其特征在于,根据QLP.saas-7BS两翼探针的SNP位置在5’端设计了竞争性的FAM和HEX正向引物,在3’端设计了通用引物,引物序列在5’端分别添加不同的荧光探针标记基团,FAM的荧光探针序列为GAAGGTGACCAAGTTCATGCT,HEX的荧光探针序列为GAAGGTCGGAGTCAACGGATT。
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