[发明专利]一种结直肠癌错配修复功能的预测方法及装置

说明书

本发明公开了一种结直肠癌错配修复功能的预测方法及装置，通过获取结直肠组织的HE染色病理切片，生成所述HE染色病理切片的数字病理图像，将所述数字病理图像划分为多个子区域，提取所述多个子区域中的组织区域，通过组织分类器分类出所述组织区域中的肿瘤区域，再通过MSI/MSS分类模型将所述所有肿瘤区域划分为MSI区域和MSS区域，计算所述MSI区域的数量占所述肿瘤区域的数量的比率，并根据所述比率，输出所述HE染色病理切片的预测结果。本发明提供一种结直肠癌错配修复功能的预测方法及装置，相对于现有技术减少了对人工的依赖性，提高了效率。

技术领域

本发明涉及生物医学工程处理的技术领域，特别是涉及一种结直肠癌错配修复功能的预测方法及装置。

背景技术

结直肠癌是最常见的恶性消化系统肿瘤，识别其错配修复(MMR)功能有助于评估疾病预后、指导辅助化疗和免疫治疗，以及筛选林奇综合征患者，根据MMR状态分组，分为MMR缺失组和MMR正常组，如何评估肿瘤的MMR状态，目前常用的检测方法为免疫组化检测MMR相关的重要蛋白表达情况；

现有技术依赖于病理医生的人工判读，人工判读主观性强，存在着一定的误判误读；另一方面，结直肠癌MMR功能缺失的总体发生率不高，约10－15％，若对全部患者进行免疫组化染色判读，既耗时耗力，也不符合卫生经济学。

发明内容

本发明要解决的技术问题是：提供一种结直肠癌错配修复功能的预测方法及装置，减少对人工的依赖性，提高了效率。

为了解决上述技术问题，本发明提供了一种结直肠癌错配修复功能的预测方法，包括：

获取结直肠组织的HE染色病理切片，生成所述HE染色病理切片的数字病理图像；

将所述数字病理图像划分为多个子区域，提取所述多个子区域中的组织区域；

通过组织分类器分类出所述组织区域中的肿瘤区域，再通过MSI/MSS分类模型将所述所有肿瘤区域划分为MSI区域和MSS区域；

计算所述MSI区域的数量占所述肿瘤区域的数量的比率，并根据所述比率，输出所述HE染色病理切片的预测结果。

进一步的，获取结直肠组织的HE染色病理切片，具体为：

对手术或肠镜检查过程中获取的结直肠组织的病理切片进行HE染色处理且确保每个病理切片中具有显著浸润癌区域，以此获取所述结直肠组织的HE染色病理切片。

进一步的，将所述数字病理图像划分为多个子区域，提取所述多个子区域中的组织区域，具体为：

根据预设区域大小，将所述数字病理图像切割成多个子区域；

根据预设的RGB通道阈值，计算每个子区域中背景像素点的区域占比；

根据预设的第一阈值，将所述区域占比小于等于第一阈值的子区域定义为组织区域，并提取所有组织区域。

进一步的，根据所述比率，输出所述HE染色病理切片的预测结果，具体为：

根据预设的上阈值和下阈值，将所述比率与预设的上阈值和下阈值作对比；

若所述比率大于等于所述预设的上阈值，则输出所述HE染色病理切片的预测结果为MSI的预测评分值；

若所述比率大于所述预设的下阈值且小于所述预设的上阈值，则输出所述HE染色病理切片的预测结果IHC的预测评分值；

若所述比率小于等于所述预设的下阈值，则输出所述HE染色病理切片的预测结果为MSS的预测评分值。

进一步的，本发明还提供了一种结直肠癌错配修复功能的预测装置，包括：图像生成模块、图像处理模块、图像分类模块和数据处理模块，具体为：