[发明专利]用于预测晚期肺腺癌免疫治疗疗效的试剂盒和系统

权利要求书

1.用于预测晚期肺腺癌的免疫治疗疗效的生物标志物，其包括：

EGFR、PTPRD、ERBB4、NTRK3、ZFHX3、RB1和EPHB1。

2.用于预测晚期肺腺癌的免疫治疗疗效的试剂盒，其特征在于，包含特异性检测EGFR、PTPRD、ERBB4、NTRK3、ZFHX3、RB1和/或EPHB1基因突变的试剂。

3.根据权利要求2所述的试剂盒，其中所述试剂盒的试剂包含选自核酸提取试剂、基因的特异性引物或探针、PCR试剂和核酸测序试剂中的一种或多种。

4.用于预测晚期肺腺癌的免疫治疗疗效的系统，其特征在于，所述系统包括以下的模块：

评估模块I），其评估所述患者的肿瘤组织中的EGFR、PTPRD、ERBB4、NTRK3、ZFHX3、RB1和/或EPHB1基因的体细胞非同义突变；

计算模块II），将所述发生了体细胞非同义突变的基因数进行加和得到SUM值；

其中所述SUM值的计算方法为：若样本在所述7基因中的n个基因中发生了体细胞非同义突变，而其他7-n个基因中无体细胞突变或仅有同义突变或突变发生在非编码区，则该样本的SUM=n；若在7基因中均无体细胞突变或仅有同义突变或突变发生在非编码区，则SUM=0；

其中n为整数，且0n≤7；其中发生了体细胞非同义突变是指，在7基因中任何一个基因发生体细胞非同义突变时，无论每个基因突变数量多少，其计入SUM值时仅计1次；

判断模块III），基于计算模块的SUM值结果，与界定值比较，若大于或等于界定值，则判断为治疗有效，低于界定值则无效；从而预测晚期肺腺癌的免疫治疗的疗效。

5.根据权利要求4所述的系统，其中所述界定值为1。

6.根据权利要求4所述的系统，其中所述评估是指，比较肿瘤组织与对照组织的测序数据，以获得EGFR、PTPRD、ERBB4、NTRK3、ZFHX3、RB1和/或EPHB1基因的体细胞非同义突变信息。

7.一种计算设备，其特征在于，其包含：

至少一个处理单元；和

至少一个存储器，所述存储器与耦合至所述处理单元，并存储用于由所述处理单元执行的指令，所述指令当被执行时，所述设备能够实现预测晚期肺腺癌的免疫治疗疗效，所述预测包括如下步骤：

a）其评估所述患者的肿瘤组织中的EGFR、PTPRD、ERBB4、NTRK3、ZFHX3、RB1和/或EPHB1基因的体细胞非同义突变；

b）将所述发生了体细胞非同义突变的基因数进行加和得到SUM值；所述SUM值的计算方法为：若样本在所述7基因中的n个基因中发生了体细胞非同义突变，而其他7-n个基因中无体细胞突变或仅有同义突变或突变发生在非编码区，则该样本的SUM=n；若在7基因中均无体细胞突变或仅有同义突变或突变发生在非编码区，则SUM=0；

其中n为整数，且0n≤7；其中发生了体细胞非同义突变是指，在7基因中任何一个基因发生体细胞非同义突变时，无论每个基因突变数量多少，其计入SUM值时仅计1次；

c）基于步骤b）的SUM值结果，与界定值比较，若大于或等于界定值则判断免疫治疗有效，低于界定值则无效；从而预测晚期肺腺癌的免疫治疗的疗效。

8.根据权利要求7所述的设备，其中所述界定值为1。