[发明专利]全切片病理图像读图系统有效
申请号: | 202110578196.2 | 申请日: | 2021-05-26 |
公开(公告)号: | CN113470791B | 公开(公告)日: | 2022-04-22 |
发明(设计)人: | 王书浩;王朗 | 申请(专利权)人: | 透彻影像(北京)科技有限公司 |
主分类号: | G16H30/20 | 分类号: | G16H30/20;G06F9/54 |
代理公司: | 北京冠和权律师事务所 11399 | 代理人: | 赵银萍 |
地址: | 100000 北京市大兴区北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 切片 病理 图像 读图 系统 | ||
1.一种全切片病理图像读图系统,其特征在于,包括:
驱动接口层:用于获取病理图像的文件标识符,根据所述文件标识符,确定文件格式,并确定所述文件格式对应的统一文件接口;
缓存层:用于基于所述统一文件接口,存储对应的病理图像至预设的内存,生成病理图像数据,并向RPC层应用或应用程序接口层优先提供病理图像数据;
RPC层:用于基于预设的RPC框架内的调用机制,获取并调用病理图像数据,确定调用结果;其中,
所述调用机制包括本地调用和RPC调用;
所述应用程序接口层用于对所述调用结果进行统一封装,生成应用程序接口,并向驱动接口层、缓存层和RPC层统一提供。
2.如权利要求1所述的一种全切片病理图像读图系统,其特征在于,所述驱动接口层包括:
图像存储模块:用于获取病理图像所在的文件存储系统,查找所述文件存储系统的文件标识符,并根据所述文件标识符,将对应的文件存储系统进行统一的接口封装,确定文件系统接口;
图像格式模块:用于根据所述文件系统接口,读取并解析对应的文件存储系统,确定文件格式;其中,
所述文件格式至少包括TIFF、TIF、SVS、KFB、TMAP、MDSX和NDPI;
驱动接口模块:用于基于预设的格式验证机制和文件标识符,验证病理图像的文件格式,确定筛选病理图像,并格式解析所述筛选病理图像的文件格式,生成统一文件接口。
3.如权利要求2所述的一种全切片病理图像读图系统,其特征在于,所述图像存储模块包括:
存储介质单元:用于获取病理图像所在的文件存储系统,确定所述文件存储系统的存储介质;
文件标识符单元:用于根据所述存储介质,生成文件存储系统的文件标识符;
应用编程接口单元:用于根据所述文件标识符,为对应的文件存储系统提供应用编程接口;
优先存储数据单元:用于基于ALLUXIO内存的层次架构,通过所述应用编程接口,优先存储病理图像,确定优先存储数据;
文件系统接口单元:用于基于所述文件标识符,将优先存储数据和对应的文件存储系统进行统一的接口封装,确定文件系统接口。
4.如权利要求3所述的一种全切片病理图像读图系统,其特征在于,所述优先存储数据单元包括:
病理数据子单元:用于获取病理图像,根据所述病理图像,生成病理数据;
公共接口子单元:用于基于ALLUXIO内存的层次架构,读取所述病理数据的存储层,将所述病理数据从所在的存储层移动至ALLUXIO缓存,并生成公共接口;
连接子单元:通过所述公共接口,连接ALLUXIO内存的层次架构和文件存储系统。
5.如权利要求2所述的一种全切片病理图像读图系统,其特征在于,所述驱动接口模块包括:
解析数据子单元:用于获取病理图像的文件标识符,解析所述文件标识符对应的文件系统信息,生成解析数据;
验证结果子单元:用于基于解析结果,验证病理图像的文件系统是否可用,确定验证结果;
格式化子单元:用于当所述验证结果显示病理图像的文件系统不可用时,格式化所述病理图像;
文件格式子单元:用于当所述验证结果显示病理图像的文件系统可用时,对所述文件系统进行格式解析,并确定文件格式;
格式解析子单元:用于根据所述文件格式,调用文件格式对应的统一文件接口。
6.如权利要求1所述的一种全切片病理图像读图系统,其特征在于,所述缓存层包括第一层哈希表和第二层哈希表,所述第一层哈希表和第二层哈希表均可配置的,并设有缓存淘汰机制;其中,
所述第一层哈希表以图像文件标识符为索引;
所述第二层哈希表以图像块层级和图像块位置的图像块组合作为索引;
所述缓存淘汰机制由LRU算法和超时时间组合实现。
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