[发明专利]用于鉴定棉花抗高温性状的InDel分子标记及其应用

说明书

本发明公开了用于鉴定棉花抗高温性状的InDel分子标记及其应用。本发明具体地公开了一种棉花抗高温基因InDel分子标记ProIn/ProDel22，所述InDel分子标记位于GhHSP70基因编码区起始密码子上游‑1590bp处的启动子区域，存在插入或缺失22bp的DNA片段。实验表明，本发明分子标记ProIn/ProDel22能准确、可靠、有效地区分抗高温棉花材料，且不受环境因素影响，可简便、快速、高通量地应用于棉花育种实践。ProDel22基因型棉花材料的抗高温性强，能用于陆地棉抗高温性GhHSP70的回交辅助育种。

技术领域

本发明属于棉花抗性分子标记开发和分子标记辅助育种技术领域，涉及用于鉴定棉花抗高温性状的InDel分子标记及其应用，具体涉及一种适用于陆地棉非生物抗性种质快速筛选和回交育种的新型且简便的分子标记及辅助选择方法。

背景技术

棉花(Gossypium spp)为双子叶植物，是唯一由种子生产纤维的农作物，作为重要的纺织原料，棉花是全球范围内最重要的经济作物之一，也是我国重要的农产品之一，其中栽培最广泛的是陆地棉(Gossypium hirsutum)，其产量约占世界棉花总产量的90％。近年来，日益频发的高温热害天气严重影响着棉花的生长环境，持续极端高温虽然促使棉花阶段发育加快、生育期提前，但影响了棉花的正常生理代谢，缩短了棉铃及棉纤维的形成发育过程，进而影响棉纤维的生长发育，造成棉纤维变短，品质下降。同时高温胁迫会降低棉花种子萌发率，使根系生长及植株的生长受到抑制，导致棉花大幅度减产。因此，抗高温育种是应对全球气候变暖的根本对策，发掘棉花抗高温胁迫能力的需求越来越迫切，培育抗高温的棉花品种，有效应对棉花生长发育进程中的极端高温逆境，是当前棉花育种的重要任务。

插入缺失标记(Insertion-deletion,InDel)是指在近缘种或同一物种不同个体之间基因组同一位点的序列发生不同大小核苷酸片段的插入或缺失，是同源序列比对产生空位(gap)的现象。InDel在基因组中分布广泛、密度大、数目众多。InDel多态性分子标记是基于插入/缺失位点两侧的序列设计特异引物进行PCR扩增的标记，其本质仍属于长度多态性标记，可利用便捷的电泳平台进行分型。InDel分子标记准确性高、稳定性好，检测简单便捷，已被应用于种质资源分析、分子辅助遗传育种、遗传图谱的构建等方面。棉花重要性状的分子标记，主要集中在产量及其构成因子、纤维品质性状、抗枯及黄萎病抗性等分子标记的筛选，对于非生物胁迫抗性的分子标记研究较少，还缺乏与抗逆性状基因紧密连锁的分子标记，限制了分子标记辅助筛选抗逆新材料的育种进程。因此，亟需开发一种新型且快速简便的棉花抗高温性状的分子标记及辅助选择育种的方法。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是如何鉴定或辅助鉴定抗高温棉花和/或加快棉花抗高温性选择育种进程。

为解决上述技术问题，本发明首先提供了一种InDel分子标记或检测InDel分子标记的物质在鉴定或辅助鉴定棉花抗高温性状中的应用，所述InDel分子标记是核苷酸序列如SEQ ID No.6所示的DNA分子和/或SEQ ID No.7所示的DNA分子。

进一步地，所述InDel分子标记位于GhHSP70基因编码区起始密码子上游-1590bp处的启动子区域。

所述GhHSP70基因为陆地棉抗性基因GhHSP70。

所述GhHSP70基因为陆地棉遗传标准系TM-1的GhHSP70基因。

所述InDel分子标记名称为ProIn/ProDel22。

进一步地，所述InDel分子标记ProIn/ProDel22的核苷酸序列如SEQ ID No.6和/或SEQ ID No.7所示。

本发明所述InDel分子标记ProIn/ProDel22可为如核苷酸序列SEQ ID No.6所示的DNA分子，命名为ProDel22。其中，SEQ ID No.6由207个核苷酸组成。