[发明专利]切片组织识别方法、装置,细胞识别模型及组织分割模型在审
申请号: | 202110421879.7 | 申请日: | 2021-04-19 |
公开(公告)号: | CN113066080A | 公开(公告)日: | 2021-07-02 |
发明(设计)人: | 周丕轩;李志宁;郝昀超;张国根 | 申请(专利权)人: | 广州信瑞医疗技术有限公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/11;G06K9/32;G06K9/38;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人: | 张萌 |
地址: | 510700 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 切片 组织 识别 方法 装置 细胞 模型 分割 | ||
1.一种切片组织识别方法,其特征在于,包括:
获取待识别切片图像;
将所述待识别切片图像输入至细胞识别模型中,获取识别出的细胞类型以及识别出的细胞的位置信息;
将所述待识别切片图像输入至组织分割模型中,生成第一图像;其中,所述第一图像中包括识别出的组织区域;
将所述识别出的细胞类型以及所述识别出的细胞的位置信息与所述第一图像进行合并,生成第二图像;其中,所述第二图像中包括所述识别出的组织区域以及所述识别出的组织区域内部的细胞类型;
根据所述第二图像中所识别出的组织区域内部的细胞类型,将所述第二图像中所识别出的组织区域进行分类。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,通过如下步骤得到所述细胞识别模型,该步骤包括:
获取第一训练样本数据;其中,所述第一训练样本数据包括多张样本切片图像以及每张样本切片图像对应的标注数据,所述标注数据包括细胞类型以及细胞的位置信息;
基于所述第一训练样本数据将初始模型训练至收敛,得到所述细胞识别模型。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,通过如下步骤得到所述组织分割模型,该步骤包括:
获取第二训练样本数据;其中,所述第二训练样本数据包括多张样本切片图像以及每张样本切片图像对应的标注数据,所述标注数据包括划分好的组织区域;
基于所述第二训练样本数据将初始模型训练至收敛,得到所述组织分割模型。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述获取待识别切片图像包括:
获取第一组织切片图像;
将所述第一组织切片图像分割为多个预设尺寸的所述待识别切片图像;
相应的,在得到每个所述待识别切片图像对应的第二图像的分类结果后,所述方法还包括:
将每个所述待识别切片图像对应的包含分类结果的第二图像进行拼接,形成第二组织切片图像,其中,所述第二组织切片图像与所述第一组织切片图像中的组织区域和细胞位置一致。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述第二图像中所识别出的组织区域内部的细胞类型,将所述第二图像中所识别出的组织区域进行分类,包括:
根据所述第二图像中所识别出的组织区域内部的细胞类型,将所述第二图像重新进行像素填充;
其中,不同细胞类型对应的组织区域所填充的像素值不同,同一细胞类型对应的组织区域填充的像素值相同。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,在所述根据所述第二图像中所识别出的组织区域内部的细胞类型,将所述第二图像重新进行像素填充之后,所述方法还包括:
确定出所述第二图像中包含病变细胞类型的组织区域;
计算所述病变细胞类型的组织区域和识别出的全部组织区域的比值。
7.一种细胞识别模型,其特征在于,包括:图像特征提取层、感兴趣区域识别层、分类器以及回归层;
所述图像特征提取层用于接收输入的待识别切片图像,并利用内部的卷积层提取所述待识别切片图像中的特征信息;
所述感兴趣区域识别层与所述图像特征提取层连接;所述感兴趣区域识别层用于根据所述待识别切片图像中的特征信息,识别出感兴趣区域;
所述分类器与所述感兴趣区域识别层连接,所述分类器用于对所述感兴趣区域进行分类;
所述回归层与所述感兴趣区域识别层连接,所述回归层用于对所述感兴趣区域进行框选,并对框选区域进行修正;其中,所述框选区域包含识别的细胞。
8.一种组织分割模型,其特征在于,包括:编码器、语义分割层以及解码器;
所述编码器用于对接收输入的待识别切片图像,并提取所述待识别切片图像的图像特征;
所述语义分割层与所述编码器连接,所述语义分割层用于标注所述待识别切片图像每个像素所属的对象类别;其中,所述对象类别包括组织区域类别和背景类别;
所述解码器与所述语义分割层连接,所述解码器用于根据所述待识别切片图像的图像特征以及所述待识别切片图像每个像素所属的对象类别,输出组织区域分割后的图像。
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