[发明专利]表观遗传修饰lncRNA作为肿瘤诊断或肿瘤进展预测标志物有效
申请号: | 202110421033.3 | 申请日: | 2021-04-19 |
公开(公告)号: | CN112852969B | 公开(公告)日: | 2022-06-10 |
发明(设计)人: | 周猛;侯萍;孙杰;苏建忠 | 申请(专利权)人: | 温州医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 北京预立生科知识产权代理有限公司 11736 | 代理人: | 孟祥斌 |
地址: | 325027 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 表观 遗传 修饰 lncrna 作为 肿瘤 诊断 进展 预测 标志 | ||
1.肿瘤诊断产品在制备肿瘤诊断或肿瘤进展预测试剂中的应用,所述肿瘤诊断为结肠癌、胃癌、肝癌诊断,所述肿瘤进展预测为肝癌进展预测,所述产品包括检测生物标志物的试剂,所述生物标志物为下列5hmC修饰的lncRNA的组合:ENSG00000272610 、ENSG00000274895、ENSG00000082929、ENSG00000178457、ENSG00000203706、ENSG00000204682、ENSG00000222033、ENSG00000223492、ENSG00000225680、ENSG00000226101、ENSG00000227945、 ENSG00000229459、ENSG00000230437、ENSG00000230680、ENSG00000233539、ENSG00000234899、ENSG00000235781、ENSG00000240175、ENSG00000250250、ENSG00000253381、 ENSG00000253576、ENSG00000254109、ENSG00000254645、ENSG00000257194、ENSG00000257614、ENSG00000257995、ENSG00000259152、ENSG00000259275、ENSG00000265413、ENSG00000266767、ENSG00000267240、ENSG00000268560、ENSG00000277692、ENSG00000284452、ENSG00000284954、ENSG00000286081、ENSG00000286951、ENSG00000287528和ENSG00000287969。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述产品包括检测样本中5hmC修饰的lncRNA组合或其片段存在、不存在和/或量的试剂。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述检测包括两步检测:筛选样本中5hmC修饰基因,进而检测样本中5hmC修饰的lncRNA组合或其片段存在、不存在和/或量的情况;
或者检测样本中lncRNA组合或其片段存在、不存在和/或量的情况,进而筛选其中5hmC修饰的占比。
4.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述试剂包括通过传统色谱、质谱、荧光法、特异性抗体识别的方法、电化学法、电致化学发光法、光电化学法、沉淀法、亚硫酸氢盐测序及其衍生法、单分子检测技术检测样本中5hmC修饰的lncRNA组合或其片段存在、不存在和/或量的试剂。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,沉淀法包括GLIB、CMS、JBP1、hMeDIP;亚硫酸氢盐测序及其衍生法包括BS-Seq、TAB-Seq、oxBS-Seq、TAPS、CAM-Seq、hmC-CATCH;单分子检测技术包括SMRT、纳米孔传感、单分子成像。
6.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述检测通过RT-PCR、实时定量PCR、免疫检测、原位杂交或芯片检测样本中5hmC修饰的lncRNA组合或其片段存在、不存在和/或量的情况。
7.根据权利要求2-6任意一项所述的应用,其特征在于,所述样本包括组织、体液、外周血。
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