[发明专利]一种长非编码RNA及其在诊断治疗胆管癌中的应用有效

专利信息
申请号: 202110405455.1 申请日: 2021-04-15
公开(公告)号: CN113327645B 公开(公告)日: 2022-11-29
发明(设计)人: 李蓓;卢炯;程南生 申请(专利权)人: 四川大学华西医院
主分类号: G16B15/30 分类号: G16B15/30;G16B30/00;G16B50/00;G16H50/20;C12Q1/6886
代理公司: 北京国坤专利代理事务所(普通合伙) 11491 代理人: 张国栋
地址: 610041 四*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 编码 rna 及其 诊断 治疗 胆管癌 中的 应用
【权利要求书】:

1.一种长非编码RNA的选择方法,其特征在于,所述长非编码RNA的选择方法包括以下步骤:

步骤一,收集长非编码RNA的注释数据,得到长非编码RNA对应的数据集;

步骤二,去除长非编码RNA对应的数据集之间的冗余,得到完备的长非编码RNA数据集;

所述去除长非编码RNA对应的数据集之间的冗余包括:

获取长非编码RNA对应的数据集;在预设阈值内时,基于长非编码RNA对应的数据集生成用于消除长非编码RNA对应的数据集冗余的包含非重复数据块的数据块索引的数据字典;

在传输链路带宽资源在预设阈值内时,主动进行所述数据字典和非重复数据块的同步;

判断当前长非编码RNA对应的数据集的数据块的数据块索引是否存在于数据字典中,若存在则将所述数据块替换为数据块索引;

步骤三,从完备的长非编码RNA数据集中滤除注释数据不一致的长非编码RNA后滤除没有实验证据支持的长非编码RNA,得到过滤后的长非编码RNA数据集;

所述从完备的长非编码RNA数据集中滤除注释数据不一致的长非编码RNA包括:

获取完备的长非编码RNA数据集;提取所述长非编码RNA数据集的注释数据特征;

判断所述注释数据特征是否满足数据过滤条件;若所述数据特征满足数据过滤条件,则对相应的长非编码RNA数据进行过滤;

步骤四,从所述过滤后的长非编码RNA数据集中选取表达量高且位于蛋白质编码基因间区域独立转录的长非编码RNA,作为选定的长非编码RNA;

步骤五,确定选定的长非编码RNA的细胞核与细胞质的定位信息;

步骤六,对长非编码RNA的细胞核与细胞质的定位信息进行分析,选取完全定位在细胞核的长非编码RNA作为目标长非编码RNA,完成长非编码RNA的选择。

2.如权利要求1所述长非编码RNA的选择方法,其特征在于,步骤一中,所述注释数据包括长非编码RNA的名称、基因组定位、序列和表达水平。

3.一种利用如权利要求1-2任意一项所述长非编码RNA的选择方法选择的长非编码RNA,其特征在于,所述长非编码RNA为SNHG15,核苷酸序列为SEQ ID NO:1。

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