[发明专利]疏水性电荷诱导层析最优配基密度预测方法

权利要求书

1.一种疏水性电荷诱导层析最优配基密度预测方法，其特征在于，包括以下步骤：

(1)获取目标蛋白三维结构数据，通过分子模拟构建蛋白三维结构；

(2)分析目标配基在目标蛋白表面的识别位点，确定最优识别位点间距，作为最优配基间距；

(3)依据目标层析介质的结构特性，根据所述最优配基间距预测最优配基密度。

2.根据权利要求1所述的疏水性电荷诱导层析最优配基密度预测方法，其特征在于，在步骤(2)中，采用分子对接的方法，分析目标配基在目标蛋白表面的识别位点。

3.根据权利要求1所述的疏水性电荷诱导层析最优配基密度预测方法，其特征在于，在步骤(2)中，分析目标配基在目标蛋白表面的识别位点的主要指标为作用间距和作用力。

4.根据权利要求3所述的疏水性电荷诱导层析最优配基密度预测方法，其特征在于，分析目标配基在目标蛋白表面的识别位点的主要指标包括：

(1)目标配基位于目标蛋白表面；

(2)目标配基与目标蛋白相互作用力大；

(3)目标配基识别位点间距小；

(4)目标配基识别位点之间不存在明显蛋白突出结构。

5.根据权利要求1所述的疏水性电荷诱导层析最优配基密度预测方法，其特征在于，在步骤(3)中，所述目标层析介质的结构特性为孔道结构参数。

6.根据权利要求5所述的疏水性电荷诱导层析最优配基密度预测方法，其特征在于，根据所述孔道结构参数确定目标层析介质的比表面积，并根据所述最优配基间距预测最优配基密度。

7.根据权利要求1所述的疏水性电荷诱导层析最优配基密度预测方法，其特征在于，所述目标蛋白为牛血红蛋白或木瓜蛋白酶。

8.根据权利要求1所述的疏水性电荷诱导层析最优配基密度预测方法，其特征在于，所述目标层析介质为具有多孔结构和表面羟基的亲水性介质。

9.根据权利要求8所述的疏水性电荷诱导层析最优配基密度预测方法，其特征在于，所述目标层析介质为琼脂糖凝胶或纤维素微球。

10.根据权利要求1所述的疏水性电荷诱导层析最优配基密度预测方法，其特征在于，所述目标配基为色胺和/或5-氨基苯并咪唑。