[发明专利]一种卵巢癌的免疫预后诊断标志物组合的分析方法

说明书

本发明公开一种卵巢癌的免疫预后诊断标志物组合的分析方法，标志物组合包括如下基因：CSPG5，CXCL10，CXCL11，DKK1，PI3，TNFRSF17，DUOX1，TNFRSF13B和PAEP；分析方法包括：S1、数据收集和预处理；S2、TMB分数的计算和预后分析；S3、差异分析；S4、TMB‑免疫预后相关风险评分模型的构建和评估；S5、确立临床病理因素和TMB‑IRS模型的关系；S6、CIBERSORT数据库分析；S7、统计分析。本发明通过卵巢癌9个关键的肿瘤突变负荷相关免疫预后基因，构建与TMB有关的免疫风险评分模型，将患者分为高风险组和低风险组，证明了高风险组与较差的预后有关，以及低风险组患者的免疫细胞浸润比例更高；为卵巢癌的临床治疗提供预后提示，可作为预测卵巢癌预后的新型生物标志物和潜在治疗靶标。

技术领域

本发明属于生物分子学领域，具体涉及一种卵巢癌的免疫预后诊断标志物组合的分析方法。

背景技术

卵巢癌是最常见的女性生殖系统恶性肿瘤之一，全球发病率仅次于宫颈癌，在女性生殖系统相关肿瘤死亡中排第一位。由于卵巢位于盆腔深处，体表不易触及，卵巢癌缺乏典型症状，故早期不易诊断且缺乏有效的筛查手段，加之肿瘤生长速度较快，多数患者就诊时病灶已扩散，预后较差，五年生存率较低仅30％～45％。卵巢癌的一线疗法包括手术治疗和化学疗法，但是许多卵巢癌患者对化疗药物呈原发性耐药或继发性耐药，所以我们需要寻找新的治疗方法来改善卵巢癌患者的预后。

肿瘤微环境(TME)在肿瘤的生长和治疗中起着重要作用。免疫细胞浸润是调节肿瘤微环境的关键部分，这些浸润可以协调先天性和适应性免疫反应。随着对肿瘤微环境的深入了解，免疫治疗因其持久的抗肿瘤效应已被批准用于晚期或复发性的多种类型癌症的治疗，成为治疗肿瘤的重要手段之一。卵巢癌表达高度免疫原性的组织特异性抗原，产生的免疫浸润是主要的预后因素。因此，对于卵巢癌免疫疗法的发展有很强的生物学基础。目前，免疫检查点抑制剂疗法是卵巢癌中最有前途的免疫疗法，但是免疫疗法单独使用的客观反应率不容乐观，PD(L)-1抗体与PARP抑制剂或常规化学疗法的结合在临床试验中获得了良好的反应。此外，也需要研究能够预测免疫治疗在卵巢癌疗效中的分子标志物，以筛选合适的免疫治疗人群。

肿瘤突变负荷(TMB)被定义为每百万碱基中被检测出的，体细胞基因编码错误、碱基替换、基因插入或缺失错误的总数。TMB是影响肿瘤突变程度的重要生物标志物，是预测预后和对免疫检查点抑制剂(ICIs)敏感的新兴生物标志物。TMB已成为预测黑色素瘤、非小细胞肺癌等多种癌症的有用的免疫生物标志物。来自回顾性研究数据表明，TMB较高的癌症更有可能对免疫检查点抑制剂(ICIs)做出反应。Chalmers(查尔姆斯理工大学)等研究显示，运用CGP(全面基因组测序)分析可以准确评估TMB，使用这种方法，许多肿瘤类型的高TMB患者中有很大一部分可能会受益于免疫疗法。

目前，对于TMB相关的免疫基因在卵巢癌的预后中的作用以及TMB相关的免疫基因与卵巢癌免疫细胞浸润之间的关联尚未明确。因此找到合适的卵巢癌TMB相关免疫预后标记是符合当今时代需要的。

针对上述提出的问题，现设计一种卵巢癌的免疫预后诊断标志物组合的分析方法。

发明内容

针对现有技术的不足，本发明的目的在于提供一种卵巢癌的免疫预后诊断标志物组合的分析方法，解决了现有技术中TMB相关的免疫基因在卵巢癌的预后中的作用以及TMB相关的免疫基因与卵巢癌免疫细胞浸润之间的关联尚未明确的问题。

本发明的目的可以通过以下技术方案实现：

一种卵巢癌的免疫预后诊断标志物组合的分析方法，包括如下步骤：

S1、数据收集和预处理；

S2、TMB分数的计算和预后分析；

S3、差异分析；

S4、TMB-免疫预后相关风险评分模型的构建和评估；