[发明专利]一种金针菇FW178菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用有效
申请号: | 202110379022.3 | 申请日: | 2021-04-08 |
公开(公告)号: | CN112980992B | 公开(公告)日: | 2023-02-24 |
发明(设计)人: | 吴莹莹;鲍大鹏;李燕;王莹;陈洪雨;汪滢 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 南京灿烂知识产权代理有限公司 32356 | 代理人: | 王江南 |
地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 金针菇 fw178 菌种 卫星 dna 标记 指纹 图谱 鉴定 方法 及其 构建 应用 | ||
1.一种金针菇FW178菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法,其特征在于:所述指纹图谱由6对微卫星DNA标记组成,其对应的6对引物的具体序列如下:
FfSSR13 正向引物:ATTTCTTCGGATGCTTTGGA;
反向引物:TTCTCTTTGCACACGTCGAA;
FfSSR14 正向引物:CAGATGATGCTGCAATGCTC;
反向引物:CTTTGTGGCACTATCTGCTG;
FfSSR15 正向引物:AGTCGTCGTTCAAGGTGTCG;
反向引物:CGGTTGTTTGTTCCACTTTT;
FfSSR16 正向引物:AGACCCAACACCGGACATAT;
反向引物:GGTTAGGGATGTGACGCGGT;
FfSSR17 正向引物:CCCAGATGATGCTGCAATGC;
反向引物:CGCTTTGTGGCACTATCTGC;
FfSSR20 正向引物:AAATGAACGTCGAGTGATTC;
反向引物:GACGAGTCAATCCATCCACT;
相应带型编号组合为:(4+6+10)/(4+6)/(2+10)/(3+5)/4/(1+2);
其中,引物FfSSR13对应的带型编号为4+6+10,其中编号4对应的等位基因片段的条带大小为199~199.99bp,编号6对应的等位基因片段的条带大小为211~211.99bp,编号10对应的等位基因片段的条带大小为229~229.99bp;引物FfSSR14对应的带型编号为4+6,其中编号4对应的等位基因片段的条带大小为218~218.99bp,编号6对应的等位基因片段的条带大小为222~222.99bp;引物FfSSR15对应的带型编号为2+10,其中编号2对应的等位基因片段的条带大小为195~195.99bp,编号10对应的等位基因片段的条带大小为257~257.99bp;引物FfSSR16对应的带型编号为3+5,其中编号3对应的等位基因片段的条带大小为222~222.99bp,编号5对应的等位基因片段的条带大小为226~226.99bp;引物FfSSR17对应的带型编号为4,其对应的等位基因片段的条带大小为292~292.99bp;引物FfSSR20对应的带型编号为1+2,其中编号1对应的等位基因片段的条带大小为209~209.99bp,编号2对应的等位基因片段的条带大小为211~211.99bp;
所述金针菇FW178菌种的保藏编号为GDMCC No:61513。
2.权利要求1所述的金针菇FW178菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的应用,其特征在于:所述金针菇FW178菌种的微卫星DNA标记指纹图谱用于鉴定金针菇FW178菌种的特异等位变异,和/或鉴定金针菇FW178菌种的特异性。
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