[发明专利]一种氨基糖苷类抗生素抗性基因检测引物及试剂盒

权利要求书

1.一种环境中氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物组合，其特征在于：包括35对引物对和内参16S rRNA基因序列，其中35对引物对如下：

（1）扩增aac氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1~2所示；

（2）扩增aac6'I1氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.3~4所示；

（3）扩增aac 6' -Ib akaaacA4 -01氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.5~6所示；

（4）扩增aac 6' -Ib akaaacA4-02氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.7~8所示；

（5）扩增aac6'-Ib akaaacA4-03氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对,其核苷酸序列如SEQ ID NO.9~10所示；

（6）扩增aac6'-II氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.11~12所示；

（7）扩增aac6'-Iy氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.13~14所示；

（8）扩增aacA/aphD氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.15~16所示；

（9）扩增aacC氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.17~18所示；

（10）扩增aacC1氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.19~20所示；

（11）扩增aacC2氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.21~22所示；

（12）扩增aacC4氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.23~24所示；

（13）扩增aadA-01氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.25~26所示；

（14）扩增aadA-02氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.27~28所示；

（15）扩增aadA1氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.29~30所示；

（16）扩增aadA-1-01氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.31~32所示；

（17）扩增aadA-1-02氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.33~34所示；

（18）扩增aadA2-01氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.35~36所示；

（19）扩增aadA2-02氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.37~38所示；

（20）扩增aadA2-03氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.39~40所示；

（21）扩增aadA5-01氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.41~42所示；

（22）扩增aadA5-02氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.43~44所示；

（23）扩增aadA9-01氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.45~46所示；

（24）扩增aadA9-02氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.47~48所示；

（25）扩增aadD氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.49~50所示；

（26）扩增aadE氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.51~52所示；

（27）扩增aph氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.53~54所示；

（28）扩增aph2'-Id-01氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.55~56所示；

（29）扩增aph2'-Id-02氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.57~58所示；

（30）扩增aph6ia氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.59~60所示；

（31）扩增aphA1 akakanR氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.61~62所示；

（32）扩增spcN氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.63~64所示；

（33）扩增str氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.65~66所示；

（34）扩增strA氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.67~68所示；

（35）扩增strB氨基糖苷类抗生素抗性基因的高通量定量检测引物对，其核苷酸序列如SEQ ID NO.69~70所示；

以上35对引物对在一次检测中共同使用；

所述16S rRNA基因序列如下：

GCCCGTGACCTCGTCGTATTGACTGCATCGCGTGTCGCCCTTGATCCTAAACATAACCACTAACTGCAATATCTTATTATCATCATGTTCCACAGCTCCTCAGGCTTTATTCATGTCCATTCTTCATCAAATTCGTCATTTTTCACCAAAATGCATTGTGATAAACGATTATCACTTAAGATAATCGATTGTCTTAGTGAAATTTAACCAGAAACATCATGCAGGATGTGATAATTGAATATCAACCCAGATAATCAATTATTCCTAAAACCATTTTCAAAACCTACATGCAACTAATCAAAGGGCGACACGCGATTGCAGCGAGCCTCAGACACTGGCCGTCGTTTTACACAATCAAGTCGTGACTGGGAAAACCCTGGCGCTCACTGGCTCACCTTCACGGGTGGGCCTTTCTTCGGTAGAAAATCAAAGGATCTTCTTGAGATCCTTTTTTTCTGCGCGTAATCTGCTGCTTGCAAACAAAAAAACCACCGCTACCAGCGGTGGTTTGTTTGCCGGATCAAGAGCTACCAACTCTTTTTCCGAGGTAACTGGCTTCAGCAGAGCGCAGATACCAAATACTGTTCTTCTAGTGTAGCCGTAGTTAGGCCACCACTTCAAGAACTCTGTAGCACCGCCTACATACCTCGCTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTGTCTTACCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTTACCGGATAAGGCGCAGCGGTCGGGCTGAACGGGGGGTTCGTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGACCTACACCGAACTGAGATACCTACAGCGTGAGCTATGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGGGAGAAAGGCGGACAGGTATCCGGTAAGCGGCAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCTTCCAGGGGGAAA。