[发明专利]一种真姬菇沪真30号菌种的SSR标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用有效
| 申请号： | 202110370834.1 | 申请日： | 2021-04-07 |
| 公开（公告）号： | CN112980991B | 公开（公告）日： | 2023-06-06 |
| 发明（设计）人： | 周陈力;吴莹莹;李燕;鲍大鹏;高利慧;万佳宁 | 申请（专利权）人： | 上海市农业科学院 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
| 代理公司： | 南京灿烂知识产权代理有限公司 32356 | 代理人： | 王江南 |
| 地址： | 201106 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 真姬菇沪真 30 菌种 ssr 标记 指纹 图谱 鉴定 方法 及其 构建 应用 | ||
1.一种真姬菇沪真30号菌种的SSR标记的指纹图谱鉴定方法，其特征在于：所述指纹图谱由6个SSR标记位点组成，其对应的6对引物的具体序列如下：
HMSSR5正向引物：CACACCTTACGAGGTGAGCA；
反向引物：TGTTTGATGTTAGCCGAACG；
HMSSR11正向引物：GGAGTTTGAGTTGAGGCAGC；
反向引物：ATGAACCAGACCAAAGACCG；
HMSSR18正向引物：GAGGATTGAAGGGACTGTCG；
反向引物：CCTCATCCTCCGACTCTACG；
HMSSR19正向引物：GCTTCGGCATAACAATGTCC；
反向引物：TGATTTGGTGTTGATGGTGAG；
HMSSR31正向引物：ACGACGCACCGTGGTTTAT；
反向引物：GTAGGGTAGCGGCATCGTT；
HMSSR48正向引物：GCCGTGTGACACCAAATACA；
反向引物：ACATCTAACCGACCCACGAC；
相应带型编号组合为：(8+16)/1/4/5/4/4;
其中，引物HMSSR5对应的带型编号为8+16，其中编号8对应的等位基因片段的条带大小为206~206.99bp，编号16对应的等位基因片段的条带大小为236~236.99bp；
引物HMSSR11对应的带型编号为1，其对应的等位基因片段的条带大小为263~263.99bp；
引物HMSSR18对应的带型编号为4，其对应的等位基因片段的条带大小为262~262.99bp；
引物HMSSR19对应的带型编号为5，其对应的等位基因片段的条带大小为132~132.99bp；
引物HMSSR31对应的带型编号为4，其对应的等位基因片段的条带大小为153~153.99bp；
引物HMSSR48对应的带型编号为4，其对应的等位基因片段的条带大小为118~118.99bp；
所述真姬菇沪真30号菌种的保藏编号为GDMCCNo：61536。
2.权利要求1所述的真姬菇沪真30号菌种的SSR标记的指纹图谱的应用，其特征在于：所述真姬菇沪真30号菌种的SSR标记的指纹图谱用于鉴定真姬菇沪真30号菌种的特异等位变异，和/或鉴定真姬菇沪真30号菌种的特异性。
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