[发明专利]一种转座子及其应用

说明书

本发明公开了一种转座子及其应用。本发明提供了的LINE/L1转座子，其为如下任一种：1)核苷酸序列为序列表中序列5；2)在严格条件下与1)限定的DNA序列杂交且编码具有相同功能氨基酸残基的DNA分子；3)与1)限定的DNA序列至少具有70％、至少具有75％、至少具有80％、至少具有85％、至少具有90％、至少具有95％、至少具有96％、至少具有97％、至少具有98％或至少具有99％同源性且编码具有相同功能氨基酸残基的DNA分子。本发明首次在ZmCCT基因中发现了LINE/L1转座子，且发现含有该转座子的等位基因ZmCCT‑FO，可用于鉴定待测玉米的开花时间早晚，也可以用于鉴定待测玉米的株高和穗位高。

技术领域

本发明属于生物技术领域，尤其涉及一种转座子及其应用。

背景技术

玉米是我国最重要的粮食作物之一，2019年，玉米产量接近我国粮食总产量的40％。玉米成熟期是影响玉米产量的关键性状之一，玉米成熟期延长，即玉米开花期变晚，会导致更高比例的能量消耗在营养生长阶段，增加田间遭遇病虫害的可能性。在华北地区，玉米成熟期延长，还会影响下一茬作物的轮作，在东北地区，玉米成熟期延长，还会增加冻害风险，造成减产。此外，玉米由热带植物大刍草驯化而来，大刍草对光周期敏感，在高纬度长日照条件下不能正常开花，许多热带玉米自交系仍然光周期敏感，种植在高纬度温带地区开花期特晚，甚至不开花，直接限制了热带玉米种质资源中优良等位基因不能被挖掘利用。

发明内容

本发明的一个目的是提供一种LINE/L1转座子。

本发明提供的LINE/L1转座子，其为如下任一种：

1)核苷酸序列为序列表中序列5；

2)在严格条件下与1)限定的DNA序列杂交的DNA分子；

3)与1)限定的DNA序列至少具有70％、至少具有75％、至少具有80％、至少具有85％、至少具有90％、至少具有95％、至少具有96％、至少具有97％、至少具有98％或至少具有99％同源性的DNA分子。

含有上述的LINE/L1转座子的ZmCCT等位基因也是本发明保护的范围。

上述ZmCCT等位基因为ZmCCT-FO，其为如下任一种：

1)核苷酸序列为序列表中序列14；

2)在严格条件下与1)限定的DNA序列杂交且编码具有相同功能氨基酸残基的DNA分子；

3)与1)限定的DNA序列至少具有70％、至少具有75％、至少具有80％、至少具有85％、至少具有90％、至少具有95％、至少具有96％、至少具有97％、至少具有98％或至少具有99％同源性且编码具有相同功能氨基酸残基的DNA分子。

如下A或B的物质在鉴定如下1)-3)中至少一种中的应用也是本发明保护的范围：

A、所示的物质为检测待测玉米基因组中的ZmCCT基因是否含有所述LINE/L1转座子的物质；

B、所示的物质为检测待测玉米基因组中的ZmCCT基因为等位基因ZmCCT-FO(序列15)、等位基因ZmCCT-F7还是等位基因ZmCCT-OGD的物质；

1)鉴定待测玉米的开花时间早晚；

2)鉴定待测玉米的株高；

3)鉴定待测玉米的穗位高。

上述应用中，所述检测待测玉米基因组中的ZmCCT基因是否含有LINE/L1转座子的物质为扩增LINE/L1转座子的引物；所述引物具体由IIA引物和IIB引物组成；

所述IIA引物由序列表中序列6所示的单链DNA分子和序列表中序列7所述的单链DNA分子组成；