[发明专利]小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法在审
申请号: | 202110350135.0 | 申请日: | 2021-03-31 |
公开(公告)号: | CN113113086A | 公开(公告)日: | 2021-07-13 |
发明(设计)人: | 李韬;花辰;温卓;孙政玺;李磊 | 申请(专利权)人: | 扬州大学 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00 |
代理公司: | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人: | 王玉 |
地址: | 225009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 小麦 赤霉病 dsmqtl 分析 方法 | ||
1.小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法,其特征在于,包括:
小麦赤霉病QTL数据收集,
以QTL区间大小平均值+标准差为筛选标准,去除区间过大的QTL,对QTL进行初步筛选;
将筛选后的数据导入dsMQTL软件中,获得dsMQTL。
2.根据权利要求1所述的小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法,其特征在于,收集的小麦赤霉病QTL数据包括染色体、品种名称、接种方法、接种环境、实验次数、实验地点数量、实验群体大小、置信区间、物理位置、峰值标记及位置、LOD值和表型解释率。
3.根据权利要求1所述的小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法,其特征在于,初步筛选的方法为:计算所有QTL物理区间长度平均值+标准差,以此为标准,将QTL区间平均值+标准差的QTL剔除。
4.根据权利要求1所述的小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法,其特征在于,以测序图谱为QTL映射载体获得结果dsMQTL。
5.根据权利要求1所述的小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法,其特征在于,所述dsMQTL软件基于python环境。
6.根据权利要求1所述的小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法,其特征在于,所述dsMQTL软件中使用最小二乘法进行区间拟合,软件中包含1-dsMQTL,2-dsMQTL,3-dsMQTL,4-dsMQTL这4个模型,分别假设染色体上有1、2、3、4个dsMQTL的情况。
7.根据权利要求6所述的小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法,其特征在于,在对4个模型分别进行拟合检验后,选择最符合QTL可靠性积累曲线的模型,在满足以下两个标准的前提下生成后续的dsMQTL:(1)QTL置信度的累积曲线聚类成峰,模型可以拟合;(2)一个dsMQTL至少有3个部分重叠的原始QTL。
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