[发明专利]小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法在审

专利信息
申请号: 202110350135.0 申请日: 2021-03-31
公开(公告)号: CN113113086A 公开(公告)日: 2021-07-13
发明(设计)人: 李韬;花辰;温卓;孙政玺;李磊 申请(专利权)人: 扬州大学
主分类号: G16B40/00 分类号: G16B40/00
代理公司: 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 代理人: 王玉
地址: 225009 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 小麦 赤霉病 dsmqtl 分析 方法
【权利要求书】:

1.小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法,其特征在于,包括:

小麦赤霉病QTL数据收集,

以QTL区间大小平均值+标准差为筛选标准,去除区间过大的QTL,对QTL进行初步筛选;

将筛选后的数据导入dsMQTL软件中,获得dsMQTL。

2.根据权利要求1所述的小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法,其特征在于,收集的小麦赤霉病QTL数据包括染色体、品种名称、接种方法、接种环境、实验次数、实验地点数量、实验群体大小、置信区间、物理位置、峰值标记及位置、LOD值和表型解释率。

3.根据权利要求1所述的小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法,其特征在于,初步筛选的方法为:计算所有QTL物理区间长度平均值+标准差,以此为标准,将QTL区间平均值+标准差的QTL剔除。

4.根据权利要求1所述的小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法,其特征在于,以测序图谱为QTL映射载体获得结果dsMQTL。

5.根据权利要求1所述的小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法,其特征在于,所述dsMQTL软件基于python环境。

6.根据权利要求1所述的小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法,其特征在于,所述dsMQTL软件中使用最小二乘法进行区间拟合,软件中包含1-dsMQTL,2-dsMQTL,3-dsMQTL,4-dsMQTL这4个模型,分别假设染色体上有1、2、3、4个dsMQTL的情况。

7.根据权利要求6所述的小麦抗赤霉病dsMQTL分析方法,其特征在于,在对4个模型分别进行拟合检验后,选择最符合QTL可靠性积累曲线的模型,在满足以下两个标准的前提下生成后续的dsMQTL:(1)QTL置信度的累积曲线聚类成峰,模型可以拟合;(2)一个dsMQTL至少有3个部分重叠的原始QTL。

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