[发明专利]一种检测MPL基因W515L、W515S和W515A突变的引物探针及其应用在审
申请号: | 202110343334.9 | 申请日: | 2021-03-30 |
公开(公告)号: | CN112941171A | 公开(公告)日: | 2021-06-11 |
发明(设计)人: | 郭凌川;程雪涛;焦柔;王洁;张亚飞 | 申请(专利权)人: | 迈杰转化医学研究(苏州)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 巩克栋 |
地址: | 215000 江苏省苏州市苏州工*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 mpl 基因 w515l w515s w515a 突变 引物 探针 及其 应用 | ||
1.一种检测MPL基因W515L、W515S和W515A突变的引物探针组合物,其特征在于,所述引物探针组合物包括针对MPL基因W515L、W515S和W515A突变的PCR上游引物、PCR下游引物和探针;
所述PCR下游引物的3’端末1位碱基与MPL基因W515L、W515S和W515A突变位点互补;
所述PCR下游引物的3’端末2位碱基为错配碱基。
2.根据权利要求1所述的引物探针组合物,其特征在于,所述PCR下游引物的3’端末1位碱基为简并碱基R。
3.根据权利要求1或2所述的引物探针组合物,其特征在于,所述探针的5’端修饰有荧光基团,3’端修饰有淬灭基团;
优选地,所述荧光基团包括FAM、VIC、HEX、Cy3或Cy5中的任意一种;
优选地,所述淬灭基团包括BHQ-1、BHQ-2、BHQ-3、MGB或TAMRA中的任意一种。
4.根据权利要求1-3任一项所述的引物探针组合物,其特征在于,所述PCR上游引物包括SEQ ID NO:1所示的核酸序列;
优选地,所述PCR下游引物包括SEQ ID NO:2所示的核酸序列;
优选地,所述探针包括SEQ ID NO:3所示的核酸序列。
5.一种检测MPL基因W515L、W515S和W515A突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1-4任一项所述的引物探针组合物;
优选地,所述试剂盒还包括DNA聚合酶、UDG酶、dNTP或dUTP中的任意一种或至少两种的组合。
6.一种检测MPL基因W515L、W515S和W515A突变的体系,其特征在于,所述体系包括权利要求1-4任一项所述的引物探针组合物;
优选地,所述体系还包括DNA聚合酶、UDG酶、dNTP或dUTP中的任意一种或至少两种的组合。
7.根据权利要求6所述的体系,其特征在于,所述引物探针组合物中的PCR上游引物在所述体系中的终浓度为200~1000nM;
优选地,所述引物探针组合物中的PCR下游引物在所述体系中的终浓度为200~1000nM;
优选地,所述引物探针组合物中的探针在所述体系中的终浓度为100~500nM;
优选地,所述DNA聚合酶在所述体系中的终浓度为0.1~0.5U/μL;
优选地,所述UDG酶在所述体系中的终浓度为0.01~0.05U/μL;
优选地,所述dNTP在所述体系中的终浓度为100~400μM;
优选地,所述dUTP在所述体系中的终浓度为200~600μM。
8.一种检测MPL基因W515L、W515S和W515A突变的方法,其特征在于,所述方法包括:
将待测DNA加入权利要求6或7所述的体系中,40~60℃预处理1~5min;92~98℃预变性1~5min;92~98℃变性10~30s,55~65℃退火延伸0.5~2min,40~50个循环。
9.一种检测MPL基因W515L、W515S和W515A突变的装置,其特征在于,所述装置包括:
体系配制单元:用于配制权利要求6或7所述的体系;
检测单元:用于将待测DNA加入配制的体系中,40~60℃预处理1~5min;92~98℃预变性1~5min;92~98℃变性10~30s,55~65℃退火延伸0.5~2min,40~50个循环。
10.权利要求1-4任一项所述的引物探针组合物、权利要求5所述的试剂盒、权利要求6或7所述的体系或权利要求9所述的装置在制备MPL基因突变检测产品中的应用。
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