[发明专利]一种与罗非鱼耐碱性相关的SNP标记及其应用

说明书

本发明属于水产生物技术领域，公开了一种与罗非鱼耐碱性相关的SNP标记及其应用。所述SNP标记的序列如SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：4所示，所述SEQ ID NO：1序列7981bp处或SEQ ID NO：4序列108bp处的SNP位点碱基为T或C。本发明创造性地提供了一种与罗非鱼耐碱性状相关的SNP标记，在此基础上，利用该SNP标记，可以进行耐碱罗非鱼或其亲本的筛选或检测，在罗非鱼的养殖或选育领域，都具有积极的效果，为罗非鱼耐碱分子标记辅助选择育种提供基础，及在此基础上，开发了相应的引物对、方法及相应试剂盒，具有很大的科学价值和商业价值。

技术领域

本发明属于水产生物技术领域，具体涉及一种与罗非鱼耐碱性相关的SNP标记及其应用。

背景技术

罗非鱼原产非洲，属热带性鱼类，罗非鱼属包括亚种共有100多种。罗非鱼具有生成快、产量高、食性杂、疾病少、繁殖力强等特点。罗非鱼是我国主要养殖水产品。其肉质鲜美，少刺，蛋白质含量高，富含人体所需的8种必需氨基酸，其中谷氨酸和甘氨酸含量特别高。近年已成为养殖、加工、出口的热点之一。

目前，罗非鱼的养殖主要集中在广东、广西、海南等温度较高的地区，以池塘精养为主。随着全球水资源的匮乏及气候变暖使得可利用的淡水资源锐减，淡水养殖业面临着严重的水资源短缺。罗非鱼的淡水养殖业将受到很大程度的制约。而我国盐碱水资源十分丰富，约占全国湖泊总面积的55％，但是盐碱水具有高碳酸盐碱度(HCO₃^-和CO₃^2-)、高pH、离子组成复杂等理化特点，不利于常规鱼类品种的生长，盐碱水域的开发利用存在较大的局限性，绝大部分地区盐碱水资源的利用率依然很低，开发和利用盐碱水资源十分迫切及必要。目前，耐碱种质资源的利用是解决这一问题的重要手段。因此，培育一种适合在盐碱水或海水中养殖的耐碱罗非鱼品种对于这些水域的开发利用和渔业持续发展具有重要意义。

专利CN 108207712 A公开了一种耐盐碱罗非鱼的优良品系选育方法。包括以下步骤：先收集至少三个不同品系尼罗罗非鱼作为选育基础群体，并进行耐盐碱性评估；再对上述不同品系尼罗罗非鱼每年进行一代耐盐碱选育，且连续选育至少两代，其中耐盐碱选育过程包括：繁殖池准备、亲鱼选择与培育、孵苗和捞苗、筛选和强化培养与越冬；再将经耐盐碱选育后的耐盐碱且生长优势明显的不同品系尼罗罗非鱼混合，再进行耐盐碱选育且连续选育至少四代，即为优良品系的耐盐碱罗非鱼。

专利CN 111165401 A公开了一种罗非鱼快速高效选育方法：(1)选择奥利亚罗非鱼作为选育基础群体，选出耐寒性状良好的奥利亚罗非鱼群体；(2)选择YY型超雄尼罗罗非鱼作为选育基础群体，选出耐盐碱性状良好的YY型超雄尼罗罗非鱼群体；(3)利用步骤(1)的鱼群通过自交繁殖建立耐寒奥利亚罗非鱼家系；(4)选择步骤(3)的奥利亚罗非鱼作为母本，步骤(2)的尼罗罗非鱼作为父本，进行杂交，孵化鱼苗，得到耐寒性和耐盐碱性能优良的尼奥鱼。

然而上述传统的选育方法存在选择率低、周期长等问题。因此开发一种选择强度大、不受环境影响、结果可靠、可实现早期选种和提高育种的准确性，以取得更大的遗传进展和更快的育种进程的方法尤为重要。

发明内容

针对以上现有技术存在的缺点和不足之处，本发明的首要目的在于提供一种与罗非鱼耐碱性相关的SNP标记。

本发明的另一目的在于提供一种检测上述与罗非鱼耐碱性相关的SNP标记的引物对或试剂盒。

本发明的再一目的在于提供上述试剂盒在耐碱罗非鱼亲本筛选或检测中的应用。

本发明目的通过以下技术方案实现：

一种与罗非鱼耐碱性相关的SNP标记，所述SNP标记的序列如SEQ ID NO：1或SEQID NO：4所示，所述SEQ ID NO：1序列7981bp处或SEQ ID NO：4序列108bp处的SNP位点碱基为T或C。