[发明专利]一种Cpf1蛋白及基因编辑系统有效
申请号: | 202110325073.8 | 申请日: | 2021-03-26 |
公开(公告)号: | CN113234701B | 公开(公告)日: | 2022-08-16 |
发明(设计)人: | 谢红娴;程欢欢;黄龙;兰凯 | 申请(专利权)人: | 珠海舒桐医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12N9/22 | 分类号: | C12N9/22;C12N15/55;C12N15/113 |
代理公司: | 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 | 代理人: | 汪青;周敏 |
地址: | 519013 广东省珠海*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 cpf1 蛋白 基因 编辑 系统 | ||
1.一种V型CRISPR/Cas 12a基因编辑系统,其特征在于:其包含Cpf1蛋白或者编码所述Cpf1蛋白的一种或多种多核苷酸,以及CRISPR RNA或一种或多种编码该CRISPR RNA的多核苷酸;其中,所述Cpf1蛋白为DNA核酸内切酶,所述Cpf1蛋白通过不同的核酸酶结构域在PAM序列的下游切割与CRISPR RNA互补的双链DNA;所述不同的核酸酶结构域为HNH样核酸酶结构域或RuvC样核酸酶结构域;所述PAM序列为TTNA,其中N为A、T、C、G,所述Cpf1蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,
所述的CRISPR RNA的特征为:
1) CRISPR RNA的序列格式为:5’-与Cpf1蛋白结合的直接重复序列-与靶序列互补的间隔序列-3’;
2) CRISPR RNA的间隔序列长度为15-29个碱基序列;
3) CRISPR RNA的直接重复序列长度为22-37个碱基序列;
4) CRISPR RNA的直接重复序列包含茎环结构。
2.根据权利要求1所述的V型CRISPR/Cas 12a基因编辑系统,其特征在于:所述CRISPRRNA的直接重复序列如SEQ ID NO:5所示。
3.根据权利要求2所述的V型CRISPR/Cas 12a基因编辑系统,其特征在于:所述CRISPRRNA的直接重复序列如SEQ ID NO:6至12中的任一序列所示。
4.根据权利要求1所述的V型CRISPR/Cas 12a基因编辑系统,其特征在于:所述基因编辑系统还包括辅助蛋白或编码所述辅助蛋白的一种或多种多核苷酸;所述的辅助蛋白包括Cas1蛋白、Cas2蛋白和Cas4蛋白中的一种或多种,
所述Cas1蛋白具有SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列;
所述Cas2蛋白具有SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列;
所述Cas4蛋白具有SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列。
5.一种如权利要求1至4中任一项所述的V型CRISPR/Cas 12a基因编辑系统中所述的Cpf1蛋白。
6.一种编码权利要求5所述的Cpf1蛋白的多核苷酸。
7.根据权利要求6所述的多核苷酸,其特征在于:所述多核苷酸经密码子优化用于在目的细胞中的表达。
8.一种包含权利要求6或7所述的多核苷酸的载体。
9.一种如权利要求1至4中任一项所述的V型CRISPR/Cas 12a基因编辑系统,或权利要求5所述的Cpf1蛋白,或权利要求6或7所述的多核苷酸,或权利要求8所述的载体在编辑或者检测原核生物或真核生物基因方面的应用。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于:所述应用为结合、目的切割或非目的切割DNA。
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