[发明专利]基于网格重构学习的染色体分类模型在审

专利信息
申请号: 202110324813.6 申请日: 2021-03-26
公开(公告)号: CN113191386A 公开(公告)日: 2021-07-30
发明(设计)人: 张林;易先鹏;王广杰;刘辉;李港深;路霖;周晋君 申请(专利权)人: 中国矿业大学
主分类号: G06K9/62 分类号: G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 221116 江苏省徐*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 基于 网格 学习 染色体 分类 模型
【权利要求书】:

1.一种基于网格重构学习的染色体分类方法,其特征在于:

(1)对染色体图像进行预处理;

(1a)将染色体图像放缩到448×456×1;

(1b)生成对应的类别标签向量;

(2)染色体图像的网格化;

(2a)将染色体图像重叠划分成9块,每块大小224×224×1;

(2b)完整图像经过一个卷积层降维后得到224×224×1的特征图;

(2c)将9个图像和一个特征图送入到裁剪后的Resnet50中提取特征;

(3)构建网格重构模块(Grid Reconstruction Model);

(3a)网格重构模块由两个支路组成,一条支路提取全局特征,一条支路提取局部特征;

(3b)提取全局特征:9个切割图像对应的特征向量,分别经过9个自定义权重(需学习)获得筛选后的9个特征向量,9个特征向量经过一个最大池化层,获得全局特征;

(3c)提取局部特征:9个切割图像对应的特征向量与相邻块的筛选后的特征向量相加,获得当前切割图像的特征向量;

(4)构建分类器,在模型的尾端添加由全连接层组成的11个分类器;

(5)构建GRiCoL (GRid reConstruction Learning);

(5a)本发明以裁剪后的Resnet50为骨干网络,通过设置网格化模块及网格重构模块等提出GRiCoL网络,网络主体由标准卷积层、池化层、全连接层及自定义权重层组成;

(5b) GRiCoL分两条支路,上支路先经过网格模块对染色体图像网格化,然后经过骨干网络提取特征,最后重构模块对提取的特征重构,下支路直接对完整图像通过裁剪后的Resnet50提取特征并进行分类;

(5c)骨干网络共享参数权重;

(6)对GRiCoL 网络进行训练;

为了有效避免过学习和欠学习,并综合考虑计算成本,本发明开展5折交叉验证实验并统计其测试集的分类准确率用于最终性能的评估;网络统一采用Adam优化器最小化目标函数,这是一种经实践表明性能较优,且可自适应调节学习率的优化方法;测试时只用模型的下支路进行测试。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(2a)中图像的行列均进行3切分,即宽高方向各切3块,且为重叠切割;步骤(2b)采用卷积核大小为1×11×5×1,步长为2进行降维。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(3a)中采取两条之路分别获得全局特征和局部特征;步骤(3b)中定义了9个长度为1024的权重向量(参数可学习),用于筛选特征,然后得到的9个特征向量拼接成一个3×3的特征图,最后利用最大池化获得一个全局特征向量,其代表筛选后完整图像对应的特征向量;步骤(3c)中Resnet50提取特征后将与(3b)中相邻块的筛选的特征进行相加获得融合特征,以加强相邻块的关联性。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(4)中提取到共11个特征向量,每个特征向量都会参与分类损失计算。

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(5b)中使用两条支路同时训练网络;步骤(5c)中使用骨干网络的参数将共享,测试时只用下支路即完整图像输入的支路进行预测。

6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(6)中的5折交叉验证实验是指每组实验中均将所有染色体图像分成5份,每份数据分别作为测试集,其余4份作为训练集,分别训练5个模型;测试时只用下支路完成测试,节省推理时间。

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