[发明专利]一种生物信息数据在线过滤系统在审

专利信息
申请号: 202110305047.9 申请日: 2021-03-23
公开(公告)号: CN113079138A 公开(公告)日: 2021-07-06
发明(设计)人: 颜颐欣;贾忠明;杜雪飞 申请(专利权)人: 哈尔滨理工大学
主分类号: H04L29/06 分类号: H04L29/06;G06F21/62
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 150080 黑龙*** 国省代码: 黑龙江;23
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摘要:
搜索关键词: 一种 生物 信息 数据 在线 过滤 系统
【权利要求书】:

1.一种生物信息数据在线过滤系统,其特征在于:包括数据接口机器控制器,用于实时接收网络数据,解包后供过滤模块使用;主控制器,与所述数据接口控制器连接,内部使用FPGA实现了数据过滤模块,用于根据配置信息对数据接口输入的数据进行过滤,对过滤结果生成记录的日志文件并存储;所述的主控制器为Xilinx公司生产的ZYNQ-7010芯片;本地服务器,运行在搭载了Linux操作系统的主控制器内部的APU中,用于接收用户提供给过滤模块的配置信息,也可对过滤模块的运行或停止进行操作;虚拟终端,用户与本地服务器使用虚拟终端进行交互,用于实时查看过滤模块记录日志。

2.根据权利要求1所述的一种生物信息数据在线过滤系统,其特征在于:使用了ZYNQ-7010、DDR、以太网适配器、网络数据接口与Linux操作系统。

3.DDR芯片容量为512MB连接在ZYNQ的PS端(APU),以太网适配器与网络数据接口连接在ZYNQ的PL端(FPGA),在PS端嵌入Linux操作系统对配置PL端的数据过滤模块提供配置信息。

4.根据权利要求1所述的一种生物信息数据在线过滤系统,其特征在于:所述的主处理器芯片采用Xilinx公司生产的XC7Z010CLG400-1;所述的DDR芯片选择了Micron公司生产的型号丝印为4QL77-09PZM的DDR;所述的以太网控制器选用了WIZnet公司生产的W5500芯片;所述的网络数据接口选用了型号为HR911105A的RJ45接口;所述的ZYNQ芯片中PS与PL通过芯片内部的AXI总线进行数据交换。

5.根据权利要求1所述的一种生物信息数据在线过滤系统,其特征在于:所述的本地服务器包括第一查询单元、存储单元、更新单元、第二查询单元以及删除单元;所述第一查询单元用于查询所述本地服务器中的原始配置文件是否存在变化,并当所述本地服务器中的原始文件存在变化时,跳至所述更新单元,当所述本地服务器中的原始文件未变化时,跳至所述存储单元;所述更新单元用于停止数据过滤模块工作后覆盖本地服务器中的原始配置文件,并再次启动数据过滤模块;所述第二查询单元用于查询所述本地服务器存储的数据过滤模块运行日志;所述删除单元用于删除所述本地服务器中对数据过滤功能模块的配置文件并停止数据过滤模块的运行。

6.根据权利要求1所述的一种生物信息数据在线过滤系统,其特征在于:所述的虚拟终端可使用B/S或C/S架构,供用户使用浏览器或字符终端登录使用,对过滤模块进行配置;其中,所述的过滤模块采用加入了PMT的Bloom Filter,可对数据进行高效的分组过滤。

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