[发明专利]肿瘤新生抗原预测方法、装置、设备及介质在审
申请号: | 202110303245.1 | 申请日: | 2021-03-22 |
公开(公告)号: | CN112908421A | 公开(公告)日: | 2021-06-04 |
发明(设计)人: | 彭鑫鑫;米玉涛;季序我 | 申请(专利权)人: | 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司;普瑞基准科技(北京)有限公司 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B30/00;G06N3/04;G06N5/00;G06N20/00 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 孟金喆 |
地址: | 215011 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肿瘤 新生 抗原 预测 方法 装置 设备 介质 | ||
1.一种肿瘤新生抗原预测方法,其特征在于,包括:
获取肿瘤患者的白细胞抗原序列和肽段序列;
将所述白细胞抗原序列和所述肽段序列输入至训练好的亲和力分值预测模型中,得到所述白细胞抗原序列和所述肽段序列的亲和力分值;
根据亲和力分值确定所述肽段序列是否为肿瘤新生抗原。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述亲和力分值预测模型包括编码器和解码器;
所述将所述白细胞抗原序列和所述肽段序列输入至训练好的亲和力分值预测模型中,得到所述白细胞抗原序列和所述肽段序列的亲和力分值,包括:
通过所述编码器将所述白细胞抗原序列和所述肽段序编码得到序列编码;
通过所述解码器,根据所述序列编码确定所述亲和力分值。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述通过所述编码器将所述白细胞抗原序列和所述肽段序列编码得到序列编码,包括:
通过所述编码器将所述白细胞抗原序列和所述肽段序列进行拼接处理,得到拼接序列;
通过所述编码器将所述拼接序列进行编码得到序列编码。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述解码器为基于门控机制和注意力机制构建。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述通过所述解码器,根据所述序列编码确定所述亲和力分值,包括:
通过所述解码器,根据所述序列编码提取目标序列特征;
根据所述目标序列特征确定所述亲和力分值。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述通过所述解码器,根据所述序列编码提取目标序列特征,包括:
通过所述解码器基于所述门控机制对所述序列编码提取序列特征;
通过所述解码器基于所述注意力机制对所述序列特征进行筛选,得到筛选序列特征;
通过所述解码器基于所述门控机制对所述筛选序列特征进行特征提取处理得到目标序列特征。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据亲和力分值确定所述肽段序列是否为肿瘤新生抗原,包括:
当亲和力分值达到预设阈值时,确定所述肽段序列为肿瘤新生抗原。
8.一种肿瘤新生抗原预测装置,其特征在于,包括:
序列获取模块,用于获取肿瘤患者的白细胞抗原序列和肽段序列;
亲和力分值获取模块,用于将所述白细胞抗原序列和所述肽段序列输入至训练好的预测模型中,得到所述白细胞抗原序列和所述肽段序列的亲和力分值;
肿瘤新生抗原确定模块,用于根据亲和力分值确定所述肽段序列是否为肿瘤新生抗原。
9.一种肿瘤新生抗原确定设备,其特征在于,所述肿瘤新生抗原确定设备包括:
一个或多个处理器;
存储装置,用于存储一个或多个程序;
当所述一个或多个程序被所述一个或多个处理器执行,使得所述一个或多个处理器实现如权利要求1-7中任一所述的肿瘤新生抗原预测方法。
10.一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,该程序被处理器执行时实现如权利要求1-7中任一所述的肿瘤新生抗原预测方法。
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