[发明专利]一种基于StrainNet的染色方法在审
申请号: | 202110302595.6 | 申请日: | 2021-03-22 |
公开(公告)号: | CN113052813A | 公开(公告)日: | 2021-06-29 |
发明(设计)人: | 潘晓光;王小华;令狐彬;张雅娜;宋晓晨 | 申请(专利权)人: | 山西三友和智慧信息技术股份有限公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T5/00;G06T7/38;G06T7/90;G06T11/00;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 太原荣信德知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 14119 | 代理人: | 杨凯;连慧敏 |
地址: | 030006 山西省*** | 国省代码: | 山西;14 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 strainnet 染色 方法 | ||
1.一种基于StrainNet的染色方法,其特征在于:包括下列步骤:
S100、数据采集:采集医院患者宫颈细胞病理切片的扫描图像,并对获取的图像进行标注,完成模型训练所需数据集的构建;
S200、数据预处理:预处理包括归一化、图像缩放、数据分割;
S300、模型构建:采用深度学习技术搭建识别模型,输入训练数据,完成参数模型的搭建;
S400、模型评价:使用结构相似度指数SSIM和峰值信噪比PSNR用于评估与目标图像的相似度;
S500、模型保存:当StainNet网络模型和StainGAN网络模型的预测结果通过L1损失函数获得的损失值不再降低之后,保存模型。
2.根据权利要求1所述的一种基于StrainNet的染色方法,其特征在于:所述S100数据采集中,通过使用两种载片扫描仪扫描来自医院患者的宫颈细胞病理切片,第一台扫描仪使用一个20倍物镜,分辨率为每像素0.2930米,第二台扫描仪使用了一个40倍的物镜,分辨率为0.1803米/像素,将第二台扫描仪的图像调整到分辨率为0.2930m/像素,然后对第一台扫描仪的图像进行刚性配准和非刚性配准,使第二台扫描仪的图像与第一台扫描仪的图像对齐,最终获取原始数据集用于模型的训练。
3.根据权利要求1所述的一种基于StrainNet的染色方法,其特征在于:所述S200数据预处理中,归一化方式为对每个像素点除以225,图像缩放方式为将图像数据按照大小比例全部调整为256*256的尺寸;数据分割方式为将原始数据集按照7:3的比例分为训练集和测试集。
4.根据权利要求1所述的一种基于StrainNet的染色方法,其特征在于:所述S300模型构建中,使用基于GAN的无监督染色归一化方法StainGAN训练源和目标图像不配对的生成器,通过预先训练好的StainGAN模型对训练集和测试集的源图像进行归一化处理,并将归一化后的图像作为训练过程中的Ground truth,将StainGAN模型训练后的图像与StainNet模型训练后的图像使用L1损失函数来最小化模型输出与映射图像之间的差异,L1损失函数公式如下:其中y(i)为目标值,为估计值。
5.根据权利要求1所述的一种基于StrainNet的染色方法,其特征在于:所述S300模型构建中,采用StainNet模型利用全1×1卷积将源颜色空间转化为中间颜色空间,再由中间颜色空间转化为目标颜色空间,之后StainNet模型通过使用随机梯度下降优化器进行训练,用于提高模型训练效果。
6.根据权利要求1所述的一种基于StrainNet的染色方法,其特征在于:所述S400模型评价中,测量目标图像与归一化图像之间的相似度、归一化图像与源图像之间的一致性,以评价源图像信息的保存情况,使用结构相似度指数即SSIM和峰值信噪比即PSNR用于评估与目标图像的相似度。
7.根据权利要求1所述的一种基于StrainNet的染色方法,其特征在于:所述S400模型评价中,SSIM公式如下:SSIM(x,y)=[l(x,y)]α[c(x,y)]β[s(x,y)]γ,其中l(x,y)是亮度比较,c(x,y)是对比度比较,s(x,y)是结构比较,μx和μy分别代表x,y的平均值,δx和δy分别代表x,y的标准差,δxy代表x,y的协方差,c1、c2和c3分别为常数,避免分母为0带来的系统错误,所述α、β和γ设为1。
8.根据权利要求1所述的一种基于StrainNet的染色方法,其特征在于:所述S400模型评价中,PSNR公式如下:其中MAX是表示图像点颜色的最大数值,I(i,j)为真实值,K(i,j)为预测值,m,n为像素。
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