[发明专利]一种用于获取遗传性帕金森病致病基因突变相关信息的检测方法

权利要求书

1.一种用于获取遗传性帕金森病致病基因突变相关信息的检测方法，其特征在于，提取检测对象的基因组DNA后进行包括以下步骤的处理：

S1、将基因组DNA进行片段化；

S2、将片段化的基因组DNA进行末端修复和3'末端添加碱基A；

S3、将3'末端添加碱基A的产物连接扩增接头并纯化，以进行有效连接产物的富集；

S4、将连接产物进行Pre–PCR扩增反应，富集有效产物；

S5、用探针与上述富集的有效产物模板进行液相杂交后，并与磁珠结合，洗脱未结合探针与非特异性结合不稳定文库，捕获上述模板中目标区域DNA文库；

S6、将捕获的目标区域DNA文库分离后连接完整接头，进行Post–PCR扩增反应，捕获目标区域文库；

S7、对目标区域文库进行定量和质检操作；

S8、上机测序；

S9、数据分析得到致病位点相关信息；

其中，所述探针通过遗传性帕金森病相关基因和/或相关突变点设计得到，包括SNCA、SNCB、SORL1、SQSTM1、TF、TMEM106B、TREM2、TRPM7、TTR、UBB、UBQLN2、VCP、VEGF、ZCWPW1、UCHL1、PINK1、LRRK2、ATP13A2、GIGYF2、HTRA2、FBX07、ATXN2、ATXN3、GBA、SYT11、STK39、MCCC1、DGKQ、BST1、ITGA8、LRRK2、CCDC62、MAPT、PARK2、PARK7ITPKB、IL1R2、SCN3A、SATB1、NCKIPSD、ALAS1、TLR9、DNAH1、BAP1、PHF7、NISCH、STAB1、ITIH3、ITIH4、ANK2、CAMK2D、ELOVL7、ZNF184、CTSB、PDLIM3、C8ORF58、BIN3、SH3GL2、FAM171A1、GALC、COQ7、TOX3、ATP6V0A1、PSMC3IP、TUBG2中的至少一种。

2.根据权利要求1所述的用于获取遗传性帕金森病致病基因突变相关信息的检测方法，其特征在于，所述基因组DNA来源于人类。

3.根据权利要求1所述的用于获取遗传性帕金森病致病基因突变相关信息的检测方法，其特征在于，提取所述基因组DNA的方法包括纯化柱纯化、磁珠纯化或酚氯仿提取。

4.根据权利要求1所述的用于获取遗传性帕金森病致病基因突变相关信息的检测方法，其特征在于，S7中所述定量的方法包括基于荧光定量原理的定量装置定量、Q–PCR定量或电泳。

5.根据权利要求1所述的用于获取遗传性帕金森病致病基因突变相关信息的检测方法，其特征在于，S1中所述基因组DNA片段化的方法包括超声破碎、转座酶酶切或限制性内切酶酶切。

6.根据权利要求1所述的用于获取遗传性帕金森病致病基因突变相关信息的检测方法，其特征在于，S5和S6中所述捕获方法包括液相探针捕获、固相芯片液相杂交捕获或PCR富集。

7.根据权利要求1所述的用于获取遗传性帕金森病致病基因突变相关信息的检测方法，其特征在于，S8中所述上机测序通过二代测序平台进行。

8.根据权利要求1所述的用于获取遗传性帕金森病致病基因突变相关信息的检测方法，其特征在于，S9中所述数据分析的具体操作如下：通过先对所得测序数据与人类基因组的参考序列进行对比，再对所测基因的每个突变位点情况进行分析，得到遗传性帕金森病致病突变相关信息。

9.根据权利要求1至8任一项所述的用于获取遗传性帕金森病致病基因突变相关信息的检测方法，其特征在于，采用试剂盒的形式进行所述用于获取遗传性帕金森病致病基因突变相关信息检测。