[发明专利]与鸡的皮肤颜色相关的分子标记、引物组及应用

说明书

本发明公开与鸡的皮肤颜色相关的分子标记、引物组及应用，涉及家禽遗传育种技术领域。本发明提供了一种与鸡的皮肤颜色相关的SNP，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示。本发明还提供了检测所述SNP的特异性引物组和具体的检测方法，能够高效灵敏快捷的检测所述SNP序列，以鉴定皮肤颜色。本发明公开的SNP位点是独特的，具有很高的广义遗传力，能比较准确的鉴别肉鸡脱去羽毛后胸部或腿部的颜色，提高其后代鸡群皮肤颜色及胫色的一致性。

技术领域

本发明涉及家禽遗传育种技术领域，特别是涉及与鸡的皮肤颜色相关的分子标记、引物组及应用。

背景技术

禽肉的品质与皮肤颜色有一定的关系，其色泽通常作为畜禽产品的外观指标。我国的禽肉消费市场主要以白羽和黄羽肉鸡为主，黄羽肉鸡因其良好的肉质风味受到消费者的偏好。随着生活水平的提高和行业的发展，鸡肉的生产方式逐步转向大规模养殖、集中定点屠宰，而鸡肉的消费方向也逐渐向低温肉制品转变，冷鲜整鸡、冷鲜分割鸡肉、冷冻鸡肉成为主要的鸡肉消费品。鸭肉消费品的色泽、触感、气味是消费者判别肉新鲜度的主要因素，而产品的色泽因为其最直观的感受，在贮存期间色泽变化是皮肤自身氧化还原反应、酶促反应与微生物降解共同作用的结果，往往最能影响消费者的购买欲。

近些年来畜禽肉产品的颜色越来越成为人们关注的肉质特征，对畜禽肉色以及皮肤颜色的研究也逐渐增多。禽类皮肤颜色的呈现与皮肤中色素沉积、残余血红蛋白氧化等有关，其中色素如叶黄素、黑色素等的沉积是禽类皮肤颜色呈色的主要原因。畜禽皮肤呈现的红色以及黄色是由类胡萝卜素和叶黄素等黄色素沉积的结果，呈现的黑色是黑色素沉积的结果。除一些特别的品种如乌鸡等，家禽皮肤颜色大部分呈现的主要颜色为黄色，其呈色物质为类胡萝卜素和叶黄素。目前关于鸡的皮肤颜色的研究的实际应用仍然停留在营养调控水平，对于基因调控和分子标记相关的研究仍处在不断地探索和验证阶段。

分子标记辅助选择(MAS)是一种常用的分子育种技术。MAS可以直接根据遗传物质的多态性进行相应的分析，如单核苷酸多态性(SNP)。分子标记辅助选择技术在其他家畜的育种中已有相当长的历史，与传统育种方法相比，MAS具有存在范围广、遗传稳定、直观准确等优点，目前并未大规模的应用于鸡的育种中。其原因一方面是对于鸡的经济性状的分子标记研究和挖掘较少，可应用于实际育种中选择重要经济性状的分子标记不足；另一方面是分子标记的检测往往成本较高，在世代间隔短、育种群体大的鸡育种中应用分子标记辅助选择技术的成本较常规育种方法更高。但随着更多低成本检测技术的发展以及分子标记的开发，分子标记辅助选择技术在鸡的育种中的应用成本显著降低。因此，进一步挖掘分子水平上与鸡重要经济性状相关的候选基因，通过对其多态性的研究并建立相关分子遗传标记，可以有效推动优质鸡的育种工作。

发明内容

本发明的目的是提供与鸡的皮肤颜色相关的分子标记、引物组及应用，以解决上述现有技术存在的问题。

为实现上述目的，本发明提供与鸡的皮肤颜色相关的分子标记，分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其中该序列的第78位碱基为T/C。

本发明还提供一种根据所述的分子标记的引物组，所述引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO:2-3所示。

本发明还提供根据所述的分子标记或所述的引物组在鸡的皮肤颜色辅助选择中的应用。

本发明还提供根据所述的分子标记或所述的引物组在制备鸡的皮肤颜色辅助选择工具中的应用。

进一步的，所述工具为试剂、试剂盒或芯片。

本发明还提供一种快速鉴别鸡的皮肤颜色的方法，所述方法具体为：以待检测鸡的DNA为模板，利用所述的引物组进行PCR扩增，将获得的产物进行测序，分析序列碱基，根据分析结果，鉴别鸡的皮肤颜色。

进一步的，采用如SEQ ID NO:1所述的分子标记鉴别鸡的皮肤颜色，则所述引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO:2-3所示。