[发明专利]一种与抗禽致病性大肠杆菌相关的NLR信号通路及其应用

说明书

本发明涉及一种与抗禽致病性大肠杆菌相关的NLR信号通路及其应用，提供一种与抗禽致病性大肠杆菌相关的遗传标记，所述遗传标记为NLR信号通路。同时提供检测本发明第一方面所述的遗传标记的试剂在制备用于鉴定待测鸡抗禽致病性大肠杆菌的试剂盒的应用。以及提供一种用于鉴定抗禽致病性大肠杆菌的试剂盒，提供一种筛选抗禽致病性大肠杆菌的商品肉鸡的方法。通过本发明。利用与禽致病性大肠杆菌相关的标记基因进行标记辅助选择，能够有效提供家禽免疫能力。提供了NLR信号通路基因的序列及鉴定方法，通过通路基因的引物，可利用Sanger测序法建立高效准确快速的分子标记辅助育种技术，使免疫力提高，可在早期进行选育，降低育种成本，提高生产效益。

技术领域

本发明涉及一种与抗禽致病性大肠杆菌相关的NLR信号通路及其应用，属于生物技术领域。

背景技术

集约化高密度家禽业的迅速发展使家禽生产面临更多细菌性感染和炎症反应。禽致病性大肠杆菌（APEC）可引起严重的呼吸系统疾病，作为初级或继发性免疫原，经不同致病机制形成禽大肠杆菌病，每年可造成数百万美元损失，且具有人畜共感染的潜力。目前，APEC 菌株多表现为耐药性且其疫苗也仅作用于同类菌株。因此进行遗传选择—筛选抗禽致病性大肠杆菌的品种是较为有效且可行的方法。但遗传选择需要大量的成本来进行表型观察、组织病理学和存活率分析等试验。利用间接性状指标或分子标记来衡量表型、改进育种策略以降低成本尤为重要。

宿主感染后对多个组织检测基因的表达反应能更好的了解基因和通路的表达模式。已在人类的研究中证明基因表达具有中等遗传性。且研究表明不同MHC的单倍型与抗艾美球虫、禽流感和马立克氏病毒相关。因此通过特定基因或通路进行抗病品种的选育是简单有效的方法，而目前家禽生产中尚未对禽致病性大肠杆菌的抗性进行选择，更无相关遗传标记的应用。

发明内容

本发明的目的在于针对上述问题，为解决生产中抗禽致病性大肠杆菌商品肉鸡选育方法的空白，进行了大量研究，筛选出禽致病性大肠杆菌的抗性商品鸡和易感商品鸡，并进行转录组测序分析，发现免疫通路NOD-like receptor （NLR）在抗禽致病性大肠杆菌商品肉鸡的各免疫组织中显著性高表达，其与抗禽致病性大肠杆菌密切相关，从而完成本项研究，提供一种与抗禽致病性大肠杆菌相关的NLR信号通路及其应用。

本发明的目的是这样实现的，一种与抗禽致病性大肠杆菌相关的遗传标记，其特征是：遗传标记为NLR信号通路，该信号通路中NOD1（420677）、RIPK2（420215）、CARD9（427756）、MAPK3（373953）和FOS（396512）为关键标记基因。

检测权利要求1所述的遗传标记的试剂在制备用于鉴定待测鸡抗禽致病性大肠杆菌的试剂盒的应用。

所述试剂为能够扩增所述标记基因的引物组合。

所述引物组合由具有SEQ ID NO.1、NO.3、NO.5、NO.7和NO.9所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQ ID NO.2、NO.4、NO.6、NO.8和NO.10所示核苷酸序列的下游引物组成；

SEQ ID NO.1：CTGTGTCCTGCAGAAAGT

SEQ ID NO.2：CCTGCTAACTGGATCTGTATT

SEQ ID NO.3：TCGAACCAGTCCTGAGAACG

SEQ ID NO.4：CGGATGTTTCCTCTTGGGGAT

SEQ ID NO.5：CAAGGCTAGCTGAGTCAAAG

SEQ ID NO.6：CTGTTGCAGCTCTTCCTAAA

SEQ ID NO.7：GCTTTCCCTACCACACAAA

SEQ ID NO.8：CCAGATATGGATGGGCTAAAG

SEQ ID NO.9：CCGCATGGAGTTTGTCTT