[发明专利]一种针对组织病理学图像的哈希样本平衡癌症标注方法在审
申请号: | 202110228166.9 | 申请日: | 2021-03-02 |
公开(公告)号: | CN112906804A | 公开(公告)日: | 2021-06-04 |
发明(设计)人: | 吴永贤;丘林;田星;张建军;王婷;余洪华 | 申请(专利权)人: | 华南理工大学 |
主分类号: | G06K9/62 | 分类号: | G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08;G06T7/00 |
代理公司: | 广州名扬高玥专利代理事务所(普通合伙) 44738 | 代理人: | 郭琳 |
地址: | 510641 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 针对 组织 病理学 图像 样本 平衡 癌症 标注 方法 | ||
1.一种针对组织病理学图像的哈希样本平衡癌症标注方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
步骤1,利用卷积自编码器提取多类图像的特征,采用无监督的卷积自编码器CAE来提取图像块特征;
步骤2,利用哈希方法将高维特征空间的图像映射到低维二进制空间,对所有多类图像样本产生哈希编码,其中,每个哈希编码对应原始特征空间中的一个子空间,也称为哈希桶;
步骤3,计算在每个哈希桶中的抽取样本的选择比例,并挑选出具有代表性的样本;
步骤4,采用有监督卷积神经网络(CNN)用于最终的分类任务。
2.如权利要求1所述的一种针对组织病理学图像的哈希样本平衡癌症标注方法,其特征在于,所述步骤1进一步包括:采用深度学习的方法获取图像的高层语义特征,采用卷积卷积自编码器(CAE)提取多类组织病理斑块的特征,编码器将输入数据转换为低维特征,可以定义为
s=g(z) (1)
其中z和s分别代表编码器的输入数据和输出;解码器接收编码器的输出,并尝试将编码器的输入重建为其输出,解码器定义为
其中s和分别对应于低维特征和解码器的输出,因此,卷积自编码器的目标函数可以定义为
f,g=argminf,gL(z,f(g(z))) (3)
再利用随机梯度下降法对目标函数进行最小化,得到输入图像的特征。
3.如权利要求1所述的一种针对组织病理学图像的哈希样本平衡癌症标注方法,其特征在于,所述步骤2进一步包括:通过一组哈希函数将图像从原始高维特征空间投影到低维汉明空间,每个哈希函数充当一个超平面,将特征空间分为两部分,超平面的两侧被指定为“-1”或“1”,通过学习θ个哈希函数,可以在汉明空间中生成2θ个哈希桶,同一个哈希桶中的样本共享相同的哈希编码,并被视为彼此相似。
4.如权利要求3所述的一种针对组织病理学图像的哈希样本平衡癌症标注方法,其特征在于,采用迭代量化哈希(ITQ),一个包含n个样本的特征数据集可以定义为X∈Rn×d,其中d表示原始特征数据的维数,哈希的目的是根据所有样本的相似性来学习一个二进制码矩阵B∈{-1,1}n×c,其中c代表哈希编码长度,数据点x通过哈希表H(x)=[h1(x)...hc(x)]映射到二进制编码空间,将哈希函数表示为
h(x)=sgn(xwc+b) (4)
其中,wc和b分别代表哈希超平面参数和偏差,符号函数sgn(·)可以表示为
目标函数表示为
其中,W为哈希超平面系数矩阵,B为数据的哈希编码矩阵。为了便于优化,忽略不可导的符号函数sgn(·),公式(6)可以转化为
公式(7)与主成分分析(PCA)的目标函数相同,所述目标函数可以采用PCA的方式对特征数据进行降维,得到数据的前c主成分,把数据映射到低维空间,得到降维后的特征数据集V;然后,通过对数据在低维空间进行旋转,使得数据和其对应的低维空间超立方体顶点尽可能相近,每个超立方体顶点对应一个哈希编码,因此,最终的量化损失函数为
其中,B、V、R、F分别表示图像的哈希编码、PCA降维后的特征数据、旋转矩阵和Frobenius范数。其中,V为已知,未知变量为B和R;具体的迭代优化计算方法为:
先固定R以更新B:展开公式(8)得到
因为经过PCA降维后的特征数据V已经被固定了,最小化公式(9)等价于最大化
此时,B等于特征数据V经过R旋转后,最近的超立方体顶点对应哈希编码;
然后固定B以更新R:
公式(8)的最小量化过程如下,对BTV进行SVD分解,BTV=SΩST,然后得到R=SST,将迭代优化过程交替进行预设次数,即可得到较好的局部最优解,即B和R。
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