[发明专利]用于检测ST11型Hv-CRKp的试剂盒、核酸试剂及系统

说明书

本公开涉及用于检测分子标志物的试剂在制备用于检测ST11型高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的试剂盒中的用途、用于检测ST11型高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的试剂盒、核酸试剂及系统，其中，所述分子标志物包括plt‑1基因，所述plt‑1基因的核酸序列如SEQ ID NO.1所示。本公开将plt‑1基因作为ST11型Hv‑CRKp检测的特异性新型高毒力基因，将其作为ST11型碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌高毒力检测的分子标志物，通过识别ST11型碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌中是否存在plt‑1基因，能够准确区分ST11型Hv‑CRKp与传统的ST11型碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌。

技术领域

本公开涉及生物医药技术领域，具体地，涉及用于检测分子标志物的试剂在制备用于检测ST11型高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的试剂盒中的用途、用于检测ST11型高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的试剂盒、核酸试剂及系统。

背景技术

ST11型高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(ST11型Hv-CRKp)是ST11型碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的变种菌株，具体地，其是由传统的ST11型碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌获得一个约170kb的pLVPK-like毒力质粒后形成，可导致高致病率和高死亡率。然而，现有技术中，尚缺少能够快速、准确地区分ST11型Hv-CRKp与传统的ST11型碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的方法。

发明内容

本公开的目的是提供用于检测分子标志物的试剂在制备用于检测ST11型高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的试剂盒中的用途、用于检测ST11型高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的试剂盒、核酸试剂及系统。

为了实现上述目的，本公开提供用于检测分子标志物的试剂在制备用于检测ST11型高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的试剂盒中的用途，其中，所述分子标志物包括plt-1基因，所述plt-1基因的核酸序列如SEQ ID NO.1所示。

可选地，所述用于检测分子标志物的试剂包括能够特异性扩增所述plt-1基因的引物，和/或能够与所述plt-1基因特异性杂交的探针。

可选地，所述引物包括如SEQ ID NO.2～3所示的引物对。

本公开还提供用于检测ST11型高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的试剂盒，其中，该试剂盒中含有用于检测分子标志物的试剂，所述分子标志物包括plt-1基因，所述plt-1基因的核酸序列如SEQ ID NO.1所示。

可选地，所述用于检测分子标志物的试剂包括能够特异性扩增所述plt-1基因的引物，和/或能够与所述plt-1基因特异性杂交的探针。

可选地，所述引物包括如SEQ ID NO.2～3所示的引物对。

本公开还提供用于检测ST11型高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的核酸试剂，其中，该核酸试剂包括用于检测plt-1基因的引物，所述plt-1基因的核酸序列如SEQ IDNO.1所示，所述引物包括如SEQ ID NO.2～3所示的引物对。

本公开还提供用于检测ST11型高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的系统，其中，该系统包括测序装置、计算装置和输出装置；

所述测序装置用于对待测样本的总核酸进行核酸序列测序，得到总核酸序列；

所述计算装置包括存储器和处理器，所述存储器中存储有计算机程序，所述处理器被配置为执行所述存储器中存储的计算机程序，以实现如下判别：

若所述总核酸序列中含有plt-1基因序列，则判定所述待测样本中存在ST11型高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌，其中，所述plt-1基因序列如SEQ ID NO.1所示；

所述输出装置用于输出所述计算装置的判定结果。