[发明专利]一种真姬菇HM36菌种的SSR标记指纹图谱及其构建方法与应用有效

专利信息
申请号: 202110158841.5 申请日: 2021-02-04
公开(公告)号: CN112877458B 公开(公告)日: 2023-02-28
发明(设计)人: 吴莹莹;李燕;高利慧;陈洪雨;王莹;杨瑞恒 申请(专利权)人: 上海市农业科学院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/04;C12N15/11
代理公司: 南京灿烂知识产权代理有限公司 32356 代理人: 王江南
地址: 201106 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 真姬菇 hm36 菌种 ssr 标记 指纹 图谱 及其 构建 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种真姬菇HM36菌种的SSR标记的指纹图谱鉴定方法,其特征在于:

所述指纹图谱由6个SSR标记位点组成,其对应的6对引物的具体序列如下:

HMSSR5正向引物:CACACCTTACGAGGTGAGCA;

反向引物:TGTTTGATGTTAGCCGAACG;

HMSSR11正向引物:GGAGTTTGAGTTGAGGCAGC;

反向引物:ATGAACCAGACCAAAGACCG;

HMSSR22正向引物:TGCTGGTGAGTGAGTTGGAG;

反向引物:ACGGCGACATAATCTGCTCT;

HMSSR26正向引物:GTGATTGGGTTCGTGTCGTC;

反向引物:ACCTCGAGCTCAACTTCTGC;

HMSSR31正向引物:ACGACGCACCGTGGTTTAT;

反向引物:GTAGGGTAGCGGCATCGTT;

HMSSR35正向引物:TCCGTGAGAGGACGGAGTAG;

反向引物:CTCAGCAACGACGAACAACC;

相应带型编号组合为:1/2/(1+2)/(1+2)/(1+3)/(2+5);

其中,引物HMSSR5对应的带型编号为1,其对应的等位基因片段的条带大小为176~176.99bp;

引物HMSSR11对应的带型编号为2,其对应的等位基因片段的条带大小为266~266.99bp;

引物HMSSR22对应的带型编号为1+2,其中编号1对应的等位基因片段的条带大小为174~174.99bp,编号2对应的等位基因片段的条带大小为177~177.99bp;

引物HMSSR26对应的带型编号为1+2,其中编号1对应的等位基因片段的条带大小为120~120.99bp,编号2对应的等位基因片段的条带大小为126~126.99bp;

引物HMSSR31对应的带型编号为1+3,其中编号1对应的等位基因片段的条带大小为152~152.99bp,编号3对应的等位基因片段的条带大小为165~165.99bp;

引物HMSSR35对应的带型编号为2+5,其中编号2对应的等位基因片段的条带大小为125~125.99bp,编号5对应的等位基因片段的条带大小为128~128.99bp;

所述真姬菇HM36菌种的保藏编号为GDMCC No:61416。

2.权利要求1所述的真姬菇HM36菌种的SSR标记的指纹图谱的应用,其特征在于:所述真姬菇HM36菌种的SSR标记的指纹图谱用于鉴定真姬菇HM36菌种的特异等位变异,和/或鉴定真姬菇HM36菌种的特异性。

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