[发明专利]基于深度学习的植物叶片显微图像气孔分割方法有效

专利信息
申请号: 202110142547.5 申请日: 2021-02-02
公开(公告)号: CN112861693B 公开(公告)日: 2022-08-30
发明(设计)人: 黄建平;李飞;李君禹;李克新;宋文龙 申请(专利权)人: 东北林业大学
主分类号: G06V20/69 分类号: G06V20/69;G06V10/25;G06V10/26;G06V10/774;G06V10/82;G06K9/62;G06T7/62;G06N3/04
代理公司: 哈尔滨市松花江专利商标事务所 23109 代理人: 岳泉清
地址: 150040 黑龙*** 国省代码: 黑龙江;23
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摘要:
搜索关键词: 基于 深度 学习 植物 叶片 显微 图像 气孔 分割 方法
【权利要求书】:

1.基于深度学习的植物叶片显微图像气孔分割方法,其特征在于,包括以下步骤:

步骤a、获取气孔样本数据集;

步骤b、构建并训练基于深度学习的植物叶片显微图像气孔分割模型;

步骤c、计算植物叶片气孔特征参数,具体步骤如下:

步骤c1、气孔分割模型输出待测植物叶片显微图像的预测结果图像IP(x,y),IP(x,y)中的每个像素位置的取值包含三个值,分别代表:气孔孔隙像素、保卫细胞像素和背景像素;

步骤c2、将预测结果进行二值化,得到两幅二值图像,一幅由背景像素和气孔孔隙像素组成,表示为I1(x,y);另一幅由背景像素和保卫细胞像素组成,表示为I2(x,y);

步骤c3、采用形态学开和闭操作去除图像I2(x,y)中面积小于S的区域;S的取值根据植物叶片显微图像中气孔的大小进行选择;

步骤c4、采用形态学二值图像连通区域搜索方法计算图像I2(x,y)中所有闭合连通区域,并计算每一个闭合连通区域的最小外接矩形;

步骤c5、采用形态学二值图像连通区域搜索方法计算图像I1(x,y)中所有闭合连通区域,并计算每一个闭合连通区域的最小外接矩形;

步骤c6、统计图像I2(x,y)中矩形的个数,即为该图像上气孔的数量Ni,其中i为图像编号,第一幅图像i=1;

步骤c7、统计图像I1(x,y)中矩形的个数,即为该图像上开放气孔的数量Mi,其中i为图像编号,第一幅图像i=1;

步骤c8、计算n幅二值图像I2(x,y)中的气孔数量的总数根据每幅图像光学显微镜的视野面积SFOV,单位:mm2,计算气孔密度RSD,计算方法为:

步骤c9、计算每幅二值图像I2(x,y)中每个气孔保卫细胞的面积Ci,单位:像素;根据光学显微镜视野内图像像素面积R,单位:um2/像素,求得n幅二值图像I2(x,y)中气孔保卫细胞平均大小SC,计算方法为:

步骤c10、计算每幅二值图像I1(x,y)中每个气孔孔隙的面积Pi,单位:像素;根据光学显微镜视野内图像像素面积R,单位:um2/像素,求得n幅二值图像I1(x,y)中气孔保卫细胞平均大小SP,计算方法为:

2.根据权利要求1所述的基于深度学习的植物叶片显微图像气孔分割方法,其特征在于,步骤a的具体步骤如下:

步骤a1、将待测量植物叶片置于光学显微镜载物台上,调节显微镜焦距和放大倍数,获取该焦距下的叶片显微图像;

步骤a2、在500或1000放大倍数下,采用显微镜自带的深度合成功能,对多张不同焦距的图像进行融合,得到一幅清晰的叶片显微图像;

步骤a3、利用人工标注方式对气孔和保卫细胞进行像素级标注,获得气孔样本数据集。

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