[发明专利]影响猪乳头数性状的SNP分子标记及应用

说明书

本发明涉及一种影响猪乳头数性状的SNP分子标记及应用。本发明筛选得到一种SNP位点对应于国际基因组11.1版本参考序列16号染色体第61380019位G/A突变的SNP分子标记，通过逐代筛选该SNP的优势等位基因，能够提高优势等位基因频率，进而提升猪总乳头数，提高猪的繁殖性能，加快猪遗传改良进度，从而以有效提高猪养殖的经济效益。

技术领域

本发明涉及猪标记辅助选择（MAS）技术领域，具体涉及一种影响猪乳头数性状的SNP分子标记及应用。

背景技术

母猪的乳头是仔猪在哺乳期获取营养和免疫力的重要器官。近些年，在猪只繁育中，随着猪产子数性状的不断改良，猪产子数性状得到快速提高。产子数的提高甚至已经超过了母猪所能饲养的范围。因此，增加猪乳头数量一直是种猪选育的重要指标。乳头数是猪重要的繁殖性状，增加乳头数是提高仔猪存活率、促进仔猪体重增加以及均匀生长的重要手段。因而，对乳头数性状的选育已十分必要，以提高猪生产性能。分子标记辅助育种成为改良这一性状的重要途径。

母猪繁殖性能对猪场的生产效益有着巨大的影响，而乳头数是评价种猪繁殖性能的重要指标之一。充足的乳头数才能实现仔猪多产多活的需求，与仔猪的生长发育和免疫健康也密切相关。乳头数为中、高等遗传力性状，遗传力在0.20～0.40之间，然而在实际生产工作中，育种工作者往往从表型上直接对乳头数进行选择，简单的淘汰与留种选择并不能满足生产需要，且未充分发挥猪的生产潜能。因此，采用遗传手段对核心猪群总乳头数进行性状改良，则能加快目标性状的选育进展。这不仅有利于充分挖掘猪繁殖性能还能提高仔猪存活率和生长性能，进而提高经济效益，增强商品猪生产的竞争力。

发明内容

本发明的目的在于提供一种猪乳头数性状相关的SNP分子标记，并将其在基因型鉴定、遗传育种等方面加以应用，旨在解决母猪乳头不足的技术问题。

研究表明，乳头数是由多基因控制的数量性状。分子标记是指能反映动物个体或种群间基因组组中某种差异的特异性DNA片段。近年来，基于猪全基因组序列的公布和高密度SNP( single nucleotide polymorphism，单核苷酸多态) 芯片的开发，使得全基因组关联分析 ( Genomic-wid e association study，GWAS)在鉴别影响复杂性状的分子标记和候选基因方面具备了强有力的检测工具。本发明研究基于GWAS分析策略鉴别得到一些与猪总乳头数相关的分子标记，如将效应大的SNP运用到分子标记辅助选择和基因组选择中，可加快猪总乳头数性状的遗传改良进展提高经济效益。具体技术方案如下：

筛选得到一种位于猪16号染色体上与猪乳头数相关的SNP分子标记，其SNP位点对应于国际基因组11.1版本参考序列16号染色体第61380019位G/A突变。

所述分子标记的SNP位点的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中序列中的M是G或A，导致猪乳头数的不同。

所述影响猪有效乳头数性状的分子标记可应用在鉴定猪有效乳头数性状和猪遗传育种中。

用于鉴定上述位于猪16号染色体上与乳头数相关的SNP分子标记的引物对，包含引物P001-F和引物P002-R，其核苷酸序列如下所示：

引物P001-F：5’-TGATTATTGCTCTCTGCAGGTTGA-3’

引物P002-R：5’-TGCTCAAGTGTCAGGGTGTT-3’。

鉴定所述影响猪乳头数性状的SNP位点的方法，包括以下步骤：

（1）取猪的组织样品并提取基因组DNA；

（2）以生猪基因组DNA为模板，使用所述引物进行PCR扩增；