[发明专利]一种中药网络药理深度分析方法与系统有效
申请号: | 202110094723.2 | 申请日: | 2021-01-25 |
公开(公告)号: | CN112735534B | 公开(公告)日: | 2022-05-03 |
发明(设计)人: | 杨珍;张艳军;庄朋伟;郭虹 | 申请(专利权)人: | 天津中医药大学 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B50/10;G16B20/00;G16B25/20;G16B15/30 |
代理公司: | 北京君有知识产权代理事务所(普通合伙) 11630 | 代理人: | 焦丽雅 |
地址: | 301617 天津市*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 中药 网络 药理 深度 分析 方法 系统 | ||
1.一种中药网络药理深度分析方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
(1)获取疾病和中药相关靶点的数据;
(2)根据步骤(1)获取的靶点数据,分别构建疾病的蛋白质-蛋白质相互作用网络和中药成分调控的蛋白质-蛋白质相互作用网络,并进行交集运算得到交集网络,筛选交集网络的关键节点,得到核心靶点;
(3)根据步骤(2)得到的核心靶点进行生物学功能注释和KEGG通路分析;
(4)根据步骤(3)的结果,对网络核心节点的度degree值采用归一化法处理,分析KEGG通路t的重要性值tsig,
将网络核心节点的度degree值的最大值作为1,设核心靶点i归一化后的度值为iα(d),所述y为核心靶点i所在通路t上富集到y个核心靶点,所述N为通路t上共有N 个靶点,所述n为网络中共有核心靶点-通路一对一关系n条;
(5)根据步骤(4)通路的重要性值tsig对富集得到的通路进行排序,对通路上靶点的上下游及影响效应重新构建网络,最后选取富集到通路上影响与疾病相关效应的靶点作为中药干预疾病作用靶点。
2.根据权利要求1所述的中药网络药理深度分析方法,其特征在于,所述步骤(1)中的中药相关靶点是指中药复方、中药材、中药有效部位、中药有效成分相关靶点。
3.根据权利要求1所述的中药网络药理深度分析方法,其特征在于,所述步骤(2)中的交集运算为intersection交集运算。
4.根据权利要求1所述的中药网络药理深度分析方法,其特征在于,其中步骤(2)所述关键节点的筛选为对交集网络拓扑特征进行分析,以degree值大于2倍中位数,Betweenness Centrality、Closeness Centrality大于1倍中位数为参考标准。
5.根据权利要求1所述的中药网络药理深度分析方法,其特征在于,步骤(3)中所述生物学功能注释为GO注释。
6.根据权利要求5所述的中药网络药理深度分析方法,其特征在于,所述GO注释是根据基因功能将基因分类,其包括生物过程、分子功能、细胞组分分类。
7.根据权利要求1所述的中药网络药理深度分析方法,其特征在于,步骤(5)对通路的重要性值tsig排序后,选取排序前20的通路进一步分析。
8.根据权利要求1所述的中药网络药理深度分析方法,其特征在于,步骤(5)对通路的重要性值tsig排序后,选取排序前15的通路进一步分析。
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