[发明专利]检测可用于指导卡马西平用药的HLA-B*1502分型的引物和方法有效
申请号: | 202110067046.5 | 申请日: | 2021-01-19 |
公开(公告)号: | CN112626204B | 公开(公告)日: | 2022-11-18 |
发明(设计)人: | 陈雪青;王淑一 | 申请(专利权)人: | 福州艾迪康医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 | 代理人: | 黄素萍 |
地址: | 350008 福建省*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 用于 指导 西平 用药 hla 1502 引物 方法 | ||
1.一对检测指导卡马西平用药的HLA-B*1502分型的引物,其特征在于,包括:
特异性扩增HLA-B*1502分型的引物,其碱基序列为:
HLA-B*1502-F:TGTAAAACGACGGCCAGTGAACACACAGATCTCCAAGACCA
HLA-B*1502-R:AACAGCTATGACCATGCAGCCATACATCCTCTGGATGA。
2.如权利要求1所述的引物,其特征在于,还包括测序引物,其碱基序列为:
M13 F:TGTAAAACGACGGCCAGT
M13 R:AACAGCTATGACCATG。
3.如权利要求1所述的引物,其特征在于,还包括检测内参基因的引物actin-F和actin-R,所述检测内参基因的碱基序列为:
actin-F:CTAACTGCGCGTGCGTTCT
actin-R:AGTCCTTAGGCCGCCAGGGG。
4.如权利要求1所述的引物,其特征在于,所述正、反向引物在体系内的浓度均为0.1875uM。
5.如权利要求3所述的引物,其特征在于,所述内参基因的引物的使用浓度比为:actin-F:actin-R=1:1。
6.一种检测指导卡马西平用药的HLA B1502分型的方法,包括以下步骤:
(1)抽提外周血或骨髓中的基因组DNA;
(2)利用扩增引物HLA-B*1502-F/HLA-B*1502-R和actin-F/actin-R对(1)中的DNA进行扩增,当内参actin-F/actin-R扩增有目的条带,而HLA-B*1502-F/HLA-B*1502-R扩增无目的条带时,可确定样本HLA-B*1502分型为阴性,当两对引物的扩增都有目的条带时,需对样本进行测序检测;
(3)利用测序引物M13-F与M13-R对(2)中的扩增产物进行测序;
(4)将(3)中的测序结果与野生型HLA-B*1502等位基因序列进行比较,与HLA-B*1502等位基因序列完全相符,则可确定样本HLA-B*1502分型阳性,否则为阴性;
其中PCR扩增引物为:
HLA-B*1502-F:TGTAAAACGACGGCCAGTGAACACACAGATCTCCAAGACCA
HLA-B*1502-R:AACAGCTATGACCATGCAGCCATACATCCTCTGGATGA。
7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,扩增体系内模板DNA浓度最低为0.25ng/uL。
8.如权利要求6所述的方法,其特征在于,测序引物碱基序列为:
M13 F:TGTAAAACGACGGCCAGT
M13 R:AACAGCTATGACCATG。
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