[发明专利]检测可用于指导卡马西平用药的HLA-B*1502分型的引物和方法有效

专利信息
申请号: 202110067046.5 申请日: 2021-01-19
公开(公告)号: CN112626204B 公开(公告)日: 2022-11-18
发明(设计)人: 陈雪青;王淑一 申请(专利权)人: 福州艾迪康医学检验实验室有限公司
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6869;C12N15/11
代理公司: 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 代理人: 黄素萍
地址: 350008 福建省*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 检测 用于 指导 西平 用药 hla 1502 引物 方法
【权利要求书】:

1.一对检测指导卡马西平用药的HLA-B*1502分型的引物,其特征在于,包括:

特异性扩增HLA-B*1502分型的引物,其碱基序列为:

HLA-B*1502-F:TGTAAAACGACGGCCAGTGAACACACAGATCTCCAAGACCA

HLA-B*1502-R:AACAGCTATGACCATGCAGCCATACATCCTCTGGATGA。

2.如权利要求1所述的引物,其特征在于,还包括测序引物,其碱基序列为:

M13 F:TGTAAAACGACGGCCAGT

M13 R:AACAGCTATGACCATG。

3.如权利要求1所述的引物,其特征在于,还包括检测内参基因的引物actin-F和actin-R,所述检测内参基因的碱基序列为:

actin-F:CTAACTGCGCGTGCGTTCT

actin-R:AGTCCTTAGGCCGCCAGGGG。

4.如权利要求1所述的引物,其特征在于,所述正、反向引物在体系内的浓度均为0.1875uM。

5.如权利要求3所述的引物,其特征在于,所述内参基因的引物的使用浓度比为:actin-F:actin-R=1:1。

6.一种检测指导卡马西平用药的HLA B1502分型的方法,包括以下步骤:

(1)抽提外周血或骨髓中的基因组DNA;

(2)利用扩增引物HLA-B*1502-F/HLA-B*1502-R和actin-F/actin-R对(1)中的DNA进行扩增,当内参actin-F/actin-R扩增有目的条带,而HLA-B*1502-F/HLA-B*1502-R扩增无目的条带时,可确定样本HLA-B*1502分型为阴性,当两对引物的扩增都有目的条带时,需对样本进行测序检测;

(3)利用测序引物M13-F与M13-R对(2)中的扩增产物进行测序;

(4)将(3)中的测序结果与野生型HLA-B*1502等位基因序列进行比较,与HLA-B*1502等位基因序列完全相符,则可确定样本HLA-B*1502分型阳性,否则为阴性;

其中PCR扩增引物为:

HLA-B*1502-F:TGTAAAACGACGGCCAGTGAACACACAGATCTCCAAGACCA

HLA-B*1502-R:AACAGCTATGACCATGCAGCCATACATCCTCTGGATGA。

7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,扩增体系内模板DNA浓度最低为0.25ng/uL。

8.如权利要求6所述的方法,其特征在于,测序引物碱基序列为:

M13 F:TGTAAAACGACGGCCAGT

M13 R:AACAGCTATGACCATG。

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