[发明专利]一种定位偏分离性状的方法、装置及存储介质

权利要求书

1.一种定位偏分离性状的数据处理方法，其特征在于，包括如下步骤：

导入遗传群体待定位表型数据、遗传群体父母本及子代的基因型变异信息和基因组参考信息；

基于数据窗口划分法对所述基因组参考信息进行划分，得到多个数据窗口；

在多个所述数据窗口内对所述基因型变异信息进行偏分离程度分析处理，得到待比较偏分离程度信息；

将所述遗传群体待定位表型数据中的遗传群体子代划分为不同性状的亚群，以划分得到的亚群为标准从所述基因型变异信息中提取相对性状的偏分离效应去除变异文件和相对性状的偏分离效应增加变异文件；

通过多个所述数据窗口对所述偏分离效应去除变异文件进行偏分离程度分析处理，得到第一偏分离程度信息，并通过多个所述数据窗口对所述偏分离效应增加变异文件进行偏分离程度分析处理，得到第二偏分离程度信息；

将所述第一偏分离程度信息和所述第二偏分离程度信息与所述待比较偏分离程度信息进行比较，根据比较结果得到偏分离性状定位区段。

2.根据权利要求1所述的定位偏分离性状的数据处理方法，其特征在于，所述基于数据窗口划分法对所述基因组参考信息进行划分，得到多个数据窗口的过程包括：

根据预设步长值对所述基因组参考信息进行窗口划分，得到多个数据窗口，其中，所述预设步长值为100kb的长度。

3.根据权利要求1所述的定位偏分离性状的数据处理方法，其特征在于，在多个数据窗口内对所述基因型变异信息进行偏分离程度分析处理前，还包括对所述基因型变异信息进行优化处理步骤，其过程包括：

过滤掉所述基因型变异信息中子代基因型的假阳性位点；

根据预设孟德尔遗传理论模型对过滤后的基因型变异信息进行变异类型筛选，得到孟德尔分离比；

所述在多个数据窗口内对所述基因型变异信息进行偏分离程度分析处理，得到偏分离程度信息的过程包括：

在各个数据窗口中统计所述基因型变异信息在偏分离位点上的频数,根据所述频数得到偏分离位点个数；

对所述孟德尔分离比进行卡方检验，根据卡方检验结果的p值为标准得到偏分离位点变异信息，其中，所述p值小于0.001；

将所述偏分离位点个数和所述偏分离位点变异信息作为偏分离程度信息。

4.根据权利要求1所述的定位偏分离性状的数据处理方法，其特征在于，所述将所述遗传群体待定位表型数据中的遗传群体子代划分为至少两个不同性状的亚群，以划分得到的亚群为标准从所述基因型变异信息中提取相对性状的偏分离效应去除变异文件和相对性状的偏分离效应增加变异文件的过程包括：

通过所述遗传群体待定位表型数据构建偏分离效应去除类群和构建偏分离效应增加类群；

以所述偏分离效应去除类群和所述偏分离效应增加类群为标准从所述基因型变异信息中提取相对性状的偏分离效应去除变异文件和相对性状的偏分离效应增加变异文件。

5.根据权利要求4所述的定位偏分离性状的数据处理方法，其特征在于，所述通过所述遗传群体待定位表型数据构建偏分离效应去除类群和构建偏分离效应增加类群的过程包括：

在所述遗传群体待定位表型数据中获取多个A表型群体子代信息和多个B表型群体子代信息；

选取所有的B表型群体子代信息以及随机选取A表型群体子代信息来构建偏分离效应去除类群；

选取所有的A表型群体子代信息来构建偏分离效应增加类群。

6.根据权利要求1所述的定位偏分离性状的数据处理方法，其特征在于，所述将所述第一偏分离程度信息和所述第二偏分离程度信息与所述待比较偏分离程度信息进行比较，根据比较结果得到偏分离性状定位区段的过程包括：

将所述第一偏分离程度信息和所述第二偏分离程度信息与所述待比较偏分离程度信息进行比较，得到偏分离程度下降信息和偏分离程度增加信息；

将偏分离程度下降信息和偏分离程度增加信息得到数据重叠的数据窗口，根据所述数据重叠的数据窗口得到偏分离性状定位区段。