[发明专利]新型CRISPR DNA靶向酶及系统

权利要求书

1.一种工程化的非天然存在的CLUST.133120、CLUST.099129、CLUST.342201、CLUST.195009或CLUST.057059成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)-Cas系统，该系统包括：

(a)CRISPR相关蛋白或编码该CRISPR相关蛋白的核酸，其中该CRISPR相关蛋白包含与SEQ ID NO:1-50、101-145、301-341、501-521或601-682中任一个中列出的氨基酸序列至少80％(例如，81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％)相同的氨基酸序列；以及

(b)RNA指导物，该RNA指导物包含直接重复序列和能够与靶核酸杂交的间隔子序列；

其中该CRISPR相关蛋白能够结合该RNA指导物并且能够修饰与该间隔子序列互补的该靶核酸序列。

2.如权利要求1所述的系统，其中该直接重复序列包含与SEQ ID NO:51-72、85-87、95-100或900-915中任一个中列出的核苷酸序列至少80％(例如，81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％)相同的核苷酸序列。

3.如权利要求1或2所述的系统，其中该CRISPR相关蛋白是与SEQ ID NO:1或SEQ IDNO:2中列出的氨基酸序列具有至少80％(例如，81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％)同一性的蛋白质。

4.如权利要求3所述的系统，其中该CRISPR相关蛋白能够识别原型间隔子相邻基序(PAM)序列，其中该PAM序列包括作为5’-TTN-3’或5’-TN-3’列出的核酸序列。

5.如前述权利要求中任一项所述的系统，其中该RNA指导物的该间隔子序列包含约15个核苷酸至约55个核苷酸。

6.如前述权利要求中任一项所述的系统，其中该RNA指导物的该间隔子序列包含20至35个核苷酸。

7.如权利要求1或2所述的系统，其中该直接重复序列包含与SEQ ID NO:146-162中任一个中列出的核苷酸序列至少80％(例如，81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％)相同的核苷酸序列。

8.如权利要求1、2或7中任一项所述的系统，其中该CRISPR相关蛋白是与SEQ ID NO:101、SEQ ID NO:102或SEQ ID NO:103中列出的氨基酸序列具有至少80％(例如，81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％)同一性的蛋白质。

9.如权利要求1、2、7或8中任一项所述的系统，其中该CRISPR相关蛋白能够识别原型间隔子相邻基序(PAM)序列，其中该PAM序列包括作为5’-GTN-3’、5’-TG-3’、5’-TR-3’或5’-RATG-3’列出的核酸序列。

10.如权利要求1、2或7-9中任一项所述的系统，其中该RNA指导物的该间隔子序列包含约15个核苷酸至约55个核苷酸。

11.如权利要求1、2或7-10中任一项所述的系统，其中该RNA指导物的该间隔子序列包含26至51个核苷酸。