[发明专利]检测SDC2基因甲基化的方法在审
| 申请号： | 202080045060.9 | 申请日： | 2020-05-22 |
| 公开（公告）号： | CN114008219A | 公开（公告）日： | 2022-02-01 |
| 发明（设计）人： | 安城皖;吴泰祯 | 申请（专利权）人： | 基因特力株式会社 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C12Q1/6827;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京坤瑞律师事务所 11494 | 代理人： | 陈桉 |
| 地址： | 韩国大*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 检测 sdc2 基因 甲基化 方法 | ||
1.一种检测SDC2基因甲基化的方法，其包括：
(a)用不同地修饰甲基化SDC2基因和非甲基化SDC2基因的至少一种试剂处理样品；
(b)用特异性扩增所述甲基化SDC2基因的引物进行处理；并且
(c)用能够与由步骤(b)中的所述引物特异性扩增的甲基化SDC2基因互补杂交的探针进行处理。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述试剂是亚硫酸氢盐、酸式亚硫酸盐、二亚硫酸盐或其组合。
3.根据权利要求1所述的方法，其中至少一个胞嘧啶碱基通过所述试剂的处理转化为尿嘧啶或不同于胞嘧啶的碱基。
4.根据权利要求1所述的方法，其中步骤(b)中的所述引物包含至少一个CpG二核苷酸。
5.根据权利要求1所述的方法，其中步骤(b)中的所述引物包含选自SEQ ID NO:1、4、7、10、13、16、19、22、25、28、31和34至1140的序列。
6.根据权利要求5所述的方法，其中步骤(b)中的所述引物还包含选自SEQ ID NO:2、5、8、11、14、17、20、23、26、29、32和1141至1159的序列。
7.根据权利要求1所述的方法，其中步骤(c)中的所述探针包含选自SEQ ID NO:3、6、9、12、15、18、21、24、27、30、33和1160至1178的序列。
8.根据权利要求1所述的方法，其中使用选自以下的方法进行所述甲基化的检测：PCR、甲基化特异性PCR、实时甲基化特异性PCR、使用甲基化DNA特异性结合蛋白的PCR、使用甲基化DNA特异性结合抗体的PCR、定量PCR、基因芯片、测序、合成法测序、和连接法测序。
9.根据权利要求1所述的方法，其中所述SDC2基因甲基化是通过检测与所述探针结合并展现荧光的材料来检测的。
10.一种检测SDC2基因甲基化的组合物，其包含：
不同地修饰甲基化SDC2基因和非甲基化SDC2基因的至少一种试剂；
特异性扩增所述甲基化SDC2基因的引物；和
能够与由所述引物特异性扩增的甲基化SDC2基因互补杂交的探针。
11.根据权利要求10所述的组合物，其中所述试剂是亚硫酸氢盐、酸式亚硫酸盐、二亚硫酸盐或其组合。
12.根据权利要求10所述的组合物，其中至少一个胞嘧啶碱基通过所述试剂的处理转化为尿嘧啶或不同于胞嘧啶的碱基。
13.根据权利要求10所述的组合物，其中所述引物包含至少一个CpG二核苷酸。
14.根据权利要求10所述的组合物，其中所述引物包含选自SEQ ID NO:1、4、7、10、13、16、19、22、25、31、34和37至1143的序列。
15.根据权利要求14所述的组合物，其中所述引物还包含选自SEQ ID NO:1144至1162的序列。
16.根据权利要求10所述的组合物，其中所述探针包含选自SEQ ID NO:1163至1181的序列。
17.一种检测甲基化DNA的试剂盒，其包含根据权利要求10至16中任一项所述的组合物。
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