[发明专利]鉴定、选择和生产南方玉米锈病抗性作物的方法

权利要求书

1.鉴定具有增加的南方玉米锈病抗性的植物的方法，所述方法包括：

a. 在植物中检测与增加的南方玉米锈病抗性相关联的抗性基因等位基因，其中所述抗性基因等位基因包含：MZA9535-6 (参考序列SEQ ID NO: 18的位置186)处的“T”和C06836-1 (参考序列SEQ ID NO: 19的位置201)处的“A”；和

b. 将包含所述抗性基因等位基因的植物鉴定为具有南方玉米锈病抗性QTL等位基因，其中所述鉴定的植物具有增加的南方玉米锈病抗性。

2.权利要求1的方法，其进一步包括从育种程序反向选择植物。

3.鉴定具有增加的南方玉米锈病抗性的植物的方法，所述方法包括：

a. 在植物的基因组中检测以下中的任一种：

i. 编码具有SEQ ID NO:2中所示的氨基酸序列的多肽的多核苷酸；

ii. 编码具有与SEQ ID NO:2具有至少90%同一性的氨基酸序列的多肽的多核苷酸；

iii. 包含SEQ ID NO:1中所示的序列的多核苷酸；或

iv. (i)或(ii)的5 cM内与(i)或(ii)连锁和关联的一个或多个标记等位基因；和

b. 如果检测到(i)、(ii)或(iii)中的任一种，则将植物鉴定为具有增加的南方玉米锈病抗性。

4.增加植物中南方玉米锈病抗性的方法，其包括在植物中表达重组多核苷酸，所述重组多核苷酸编码具有与SEQ ID NO:2中所示的氨基酸序列具有至少90%序列同一性的氨基酸序列的多肽；其中与不包含所述重组多核苷酸的对照植物相比时，表达所述重组多肽的植物在所述植物中具有增加的南方玉米锈病抗性。

5.权利要求4的方法，其中所述重组多核苷酸还包含异源启动子。

6.权利要求4的方法，其进一步包括获得源自表达所述重组多核苷酸的植物的后代植物，其中与不包含所述重组多核苷酸的对照植物相比时，所述后代植物在其基因组中包含所述重组多核苷酸并且表现出增加的南方玉米锈病抗性。

7.权利要求4的方法，其中所述植物选自：拟南芥、玉蜀黍、大豆、向日葵、高粱、卡诺拉油菜、小麦、苜蓿、棉花、水稻、大麦、粟、甘蔗和柳枝稷。

8.权利要求4的方法，其中所述植物是单子叶植物。

9.鉴定NLR03基因的变体的方法，所述NLR03基因的变体给予植物增加的南方玉米锈病抗性，所述方法包括以下步骤：

a. 通过基因改组组合一个或多个编码SEQ ID NO:2的一个或多个片段、与SEQ ID NO:2具有至少90%同一性的蛋白或其片段的核苷酸序列，以产生NLR03基因的变体；和

b. 鉴定表现出增加的南方玉米锈病抗性的变体。

10.权利要求9的方法，其中所述方法还包括以下步骤：

a. 将包含通过权利要求9的方法鉴定的NLR03基因的变体的重组构建体引入可再生植物细胞中；

b. 在步骤(a)之后从所述可再生植物细胞再生转基因植物，其中所述转基因植物在其基因组中包含重组DNA构建体；和

c. 选择(b)的转基因植物，其中与不包含所述重组DNA构建体的对照植物相比时，所述转基因植物包含所述重组DNA构建体并且表现出增加的南方玉米锈病抗性。

11.权利要求9或10的方法，其中所述植物选自：拟南芥、玉蜀黍、大豆、向日葵、高粱、卡诺拉油菜、小麦、苜蓿、棉花、水稻、大麦、粟、甘蔗和柳枝稷。

12.权利要求9或10的方法，其中所述植物是单子叶植物。

13.权利要求12的方法，其中所述单子叶植物是玉蜀黍。