[发明专利]评估生物样品中与分子效应相关的分子变化的方法在审
申请号: | 202080010118.6 | 申请日: | 2020-01-21 |
公开(公告)号: | CN113330312A | 公开(公告)日: | 2021-08-31 |
发明(设计)人: | 乔纳森·斯陶贝尔;里马·艾特-贝尔卡塞姆;大卫·博内尔;法比安·帕默拉尔德 | 申请(专利权)人: | IMA生物科技公司 |
主分类号: | G01N33/50 | 分类号: | G01N33/50;G01N33/483 |
代理公司: | 中原信达知识产权代理有限责任公司 11219 | 代理人: | 金海霞;刘慧 |
地址: | 法国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 评估 生物 样品 分子 效应 相关 变化 方法 | ||
1.一种对用药生物样品中至少一种感兴趣分子对至少一种分子标志物的影响进行离体或体外评估的方法,所述方法包括:
-选择用药生物样品,其以前已被暴露到所述至少一种感兴趣分子;
-使用分子成像方法检测所述用药生物样品中所述至少一种感兴趣分子的存在,并为所述至少一种感兴趣分子获得所述用药生物样品的分子图谱;
-根据光谱信息对所述用药生物样品的分子图谱进行空间分割,以获得所述用药生物样品中所述至少一种感兴趣分子的分割图谱;
-从所述分割图谱选择第一感兴趣区域(ROI),所述第一ROI具有所述至少一种感兴趣分子的第一强度;
-测量所述第一ROI中至少一种分子标志物的强度或量;
-将所述第一ROI中至少一种分子标志物的强度或量与第二ROI中至少一种分子标志物的强度或量进行比较,其中从所述用药生物样品或另一个生物样品选择所述第二ROI。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述生物样品选自组织样品、类器官、生物流体样品例如尿液样品、血浆样品、脑脊液以及细胞悬液。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中所述用药生物样品是通过预先对以前给药过所述感兴趣分子的动物进行采样而获得的组织切片,或者其中所述用药生物样品已在体外与所述感兴趣分子接触过。
4.根据前述权利要求中的任一项所述的方法,其中所述分子成像方法选自MRI成像、PET成像、CT成像、IF、ISH、IHC和质谱或细胞仪成像,优选为选自MALDI、DESI、LESA、LA-ICP-MS和SIMS的质谱成像。
5.根据前述权利要求中的任一项所述的方法,其中所述感兴趣分子是候选分子,并且所述用药生物样品预先通过在以前给药过所述候选分子的动物中采样而获得。
6.根据权利要求1至5中的任一项所述的方法,其中从所述用药生物样品的分割图谱选择所述第二ROI,所述第二ROI与所述第一ROI在物理上不同,并具有所述感兴趣分子的第二强度。
7.根据权利要求1至5中的任一项所述的方法,其中从以前未暴露到所述感兴趣分子的第二生物样品选择所述第二ROI,所述第二生物样品来自于与所述用药生物样品相同的生物学起源,并且其中任选地,所述第一ROI与第二ROI之间的比较允许鉴定至少一种对所述感兴趣分子特异的生物标志物。
8.根据权利要求1至5中的任一项所述的方法,其中从以前已暴露到剂量浓度与用于所述用药生物样品的剂量浓度不同的所述感兴趣分子的第二生物样品选择所述第二ROI,所述第二生物样品来自于与所述用药生物样品相同的生物学起源。
9.根据权利要求1至5中的任一项所述的方法,其中从以前已被暴露到第二感兴趣分子的第二生物样品选择所述第二ROI,所述第二生物样品来自于与所述用药生物样品相同的生物学起源。
10.根据权利要求9所述的方法,其中所述感兴趣分子是两种不同的候选分子,所述第一ROI与第二ROI之间的比较允许区分所述候选分子。
11.根据权利要求9所述的方法,其用于评估和比较至少两种不同的感兴趣分子对至少一种分子标志物的影响。
12.根据前述权利要求中的任一项所述的方法,其中所述第一ROI和/或第二ROI中所述生物标志物的量或强度的测量使用分子成像方法来进行,所述分子成像方法优选地选自MSI、ISH、IF、IHC、MRI、成像质谱细胞仪、CT和PET成像,和/或其中所述第一ROI和/或第二ROI中所述生物标志物的量或强度的测量通过生物分析法来进行,所述生物分析法优选地选自质谱、电泳、配体结合测定法、核磁共振、微透析和层析、磁珠多重免疫测定法和ELISA。
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