[发明专利]快速简易提取厌氧真菌DNA的方法及应用在审

专利信息
申请号: 202011611015.3 申请日: 2020-12-30
公开(公告)号: CN112608918A 公开(公告)日: 2021-04-06
发明(设计)人: 魏亚琴;王霄霄;苟琦敏 申请(专利权)人: 甘肃省科学院生物研究所
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 北京力量专利代理事务所(特殊普通合伙) 11504 代理人: 戴治娟
地址: 730000 甘肃*** 国省代码: 甘肃;62
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摘要:
搜索关键词: 快速 简易 提取 真菌 dna 方法 应用
【权利要求书】:

1.快速简易提取厌氧真菌DNA的方法,其特征在于,所述的方法包括如下步骤:

(1)菌株培养:将厌氧真菌接种在厌氧培养基里,加入复合抗生素,静置培养;

(2)收集菌体:将步骤(1)得到的菌液离心,取菌丝体;

(3)破壁:将步骤(2)得到的菌丝体被快速液氮研磨后取0.1-1g加入到离心管中,再加入钢珠,冷却,振荡离心管,振荡期间离心管保持冷冻状态,使厌氧真菌细胞壁破碎;

(4)抽提DNA:向步骤(3)得到的溶液中加入抽提缓冲液,振荡,恒温水浴后,加入乙酸铵,混匀,冷却,离心,取上清液,弃沉淀物和钢珠;上清液用等体积的Tris饱和酚:氯仿:异戊醇溶液抽提2次,混匀,离心,去除杂蛋白;

(5)沉淀DNA:取步骤(4)得到的上层水相至另一离心管中,加入异丙醇,混匀,低温放置以沉淀DNA;离心,弃上清,用乙醇洗涤沉淀,用无菌双蒸水溶解沉淀,即得厌氧真菌DNA。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)所述的厌氧培养基的配制步骤如下:酵母膏1.0g,蛋白胨1.0g,葡萄糖1.0g,NaHCO3 7.0g,刃天青1.0g/L 1mL,L-半胱氨酸盐酸盐1.7g,晨饲前采集瘤胃液8000×g,4℃离心20min后的上清170mL,盐溶液I 165mL,盐溶液II 165mL,蒸馏水定容至1000mL;盐溶液I的配制步骤如下:NaCl 6g,(NH4)2SO4 3g,KH2PO43g,CaCl2·2H2O 0.4g,MgSO4·2H2O 0.6g,蒸馏水定容至1000mL;盐溶液II配制步骤如下:K2HPO4 4g,蒸馏水定容至1000mL。

3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)厌氧真菌的接种量为10%v/v,复合抗生素的接种量为1%v/v,所述的复合抗生素具体为复合抗生素为青霉素钠和硫酸链霉素,终浓度分别为1600IU/mL和2000IU/m L。

4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(2)所述的菌液离心的转速为5000g/min,离心时间为5min。

5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(3)所述的冷却是液氮快速研磨菌丝体后将0.1g被研磨的菌丝体置于离心管中,再加入钢珠2颗,将离心管放在液氮中冷却,振荡离心管,振荡过程中离心管保持冷冻状态,振荡时间为3-5min。

6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(4)所述的抽提缓冲液的配制步骤如下:Tris2.4228g,NaCl 1.461g,乙二胺四乙酸二钠0.9306g,十二烷基硫酸钠2g,蒸馏水定容100mL,并用HCl调pH值至8.5。

7.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(4)所述的乙酸铵加入量为浓度10M 200μL,Tris饱和酚:氯仿:异戊醇溶液的加入量是与上清液等体积。

8.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(5)所述的异丙醇加入量为上层水相的0.5-0.6倍体积,且所述的异丙醇于-20℃预冷。

9.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(5)所述的无菌双蒸水的加入量为50μL。

10.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(5)所述的乙醇加入量为1mL 75%。

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