[发明专利]快速简易提取厌氧真菌DNA的方法及应用在审
| 申请号: | 202011611015.3 | 申请日: | 2020-12-30 |
| 公开(公告)号: | CN112608918A | 公开(公告)日: | 2021-04-06 |
| 发明(设计)人: | 魏亚琴;王霄霄;苟琦敏 | 申请(专利权)人: | 甘肃省科学院生物研究所 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 北京力量专利代理事务所(特殊普通合伙) 11504 | 代理人: | 戴治娟 |
| 地址: | 730000 甘肃*** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 快速 简易 提取 真菌 dna 方法 应用 | ||
1.快速简易提取厌氧真菌DNA的方法,其特征在于,所述的方法包括如下步骤:
(1)菌株培养:将厌氧真菌接种在厌氧培养基里,加入复合抗生素,静置培养;
(2)收集菌体:将步骤(1)得到的菌液离心,取菌丝体;
(3)破壁:将步骤(2)得到的菌丝体被快速液氮研磨后取0.1-1g加入到离心管中,再加入钢珠,冷却,振荡离心管,振荡期间离心管保持冷冻状态,使厌氧真菌细胞壁破碎;
(4)抽提DNA:向步骤(3)得到的溶液中加入抽提缓冲液,振荡,恒温水浴后,加入乙酸铵,混匀,冷却,离心,取上清液,弃沉淀物和钢珠;上清液用等体积的Tris饱和酚:氯仿:异戊醇溶液抽提2次,混匀,离心,去除杂蛋白;
(5)沉淀DNA:取步骤(4)得到的上层水相至另一离心管中,加入异丙醇,混匀,低温放置以沉淀DNA;离心,弃上清,用乙醇洗涤沉淀,用无菌双蒸水溶解沉淀,即得厌氧真菌DNA。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)所述的厌氧培养基的配制步骤如下:酵母膏1.0g,蛋白胨1.0g,葡萄糖1.0g,NaHCO3 7.0g,刃天青1.0g/L 1mL,L-半胱氨酸盐酸盐1.7g,晨饲前采集瘤胃液8000×g,4℃离心20min后的上清170mL,盐溶液I 165mL,盐溶液II 165mL,蒸馏水定容至1000mL;盐溶液I的配制步骤如下:NaCl 6g,(NH4)2SO4 3g,KH2PO43g,CaCl2·2H2O 0.4g,MgSO4·2H2O 0.6g,蒸馏水定容至1000mL;盐溶液II配制步骤如下:K2HPO4 4g,蒸馏水定容至1000mL。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)厌氧真菌的接种量为10%v/v,复合抗生素的接种量为1%v/v,所述的复合抗生素具体为复合抗生素为青霉素钠和硫酸链霉素,终浓度分别为1600IU/mL和2000IU/m L。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(2)所述的菌液离心的转速为5000g/min,离心时间为5min。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(3)所述的冷却是液氮快速研磨菌丝体后将0.1g被研磨的菌丝体置于离心管中,再加入钢珠2颗,将离心管放在液氮中冷却,振荡离心管,振荡过程中离心管保持冷冻状态,振荡时间为3-5min。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(4)所述的抽提缓冲液的配制步骤如下:Tris2.4228g,NaCl 1.461g,乙二胺四乙酸二钠0.9306g,十二烷基硫酸钠2g,蒸馏水定容100mL,并用HCl调pH值至8.5。
7.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(4)所述的乙酸铵加入量为浓度10M 200μL,Tris饱和酚:氯仿:异戊醇溶液的加入量是与上清液等体积。
8.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(5)所述的异丙醇加入量为上层水相的0.5-0.6倍体积,且所述的异丙醇于-20℃预冷。
9.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(5)所述的无菌双蒸水的加入量为50μL。
10.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(5)所述的乙醇加入量为1mL 75%。
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