[发明专利]一种检测布鲁氏菌阿米卡星耐药性RT-PCR试剂盒及其使用方法有效
| 申请号: | 202011598557.1 | 申请日: | 2020-12-29 |
| 公开(公告)号: | CN113186308B | 公开(公告)日: | 2022-06-21 |
| 发明(设计)人: | 杨晓雯;姜海;赵鸿雁;朴东日;田国忠;范玉 | 申请(专利权)人: | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01 |
| 代理公司: | 北京思海天达知识产权代理有限公司 11203 | 代理人: | 张立改 |
| 地址: | 102206 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 检测 布鲁氏菌 阿米卡星 耐药性 rt pcr 试剂盒 及其 使用方法 | ||
1.一种检测布鲁氏菌阿米卡星耐药性RT-PCR试剂盒,其特征在于,该PCR试剂盒由A液、B液、阳性质控标准品和阴性质控标准品组成;所述A液包括RT-PCR缓冲液、各浓度2.5 mM的dNTP液、5 mM 的Mg2+溶液、2.5 U/μl 的RT-DNA聚合酶和灭菌双蒸水,每750 μL的A液对应包括RT-PCR缓冲液75 μL、dNTP液75 μL、Mg2+溶液75 μL、RT-DNA聚合酶25 μL、灭菌双蒸水500μL;所述B液包括用于检测布鲁氏菌的特异性引物对seq ID No.1和seq ID No.2以及探针seq ID No.3,以及检测布鲁氏菌阿米卡星耐药性的特异性引物对seq ID No.4和seq IDNo.5以及探针seq ID No.6,B液中各引物及各探针浓度均为0.2 μM,溶剂为水,各引物及各探针分别为:
seq ID No.1:5’- AATGCGATCAAGTCGGGCG -3’
seq ID No.2:5’- TGCCATCATAAAGGCCGGTG -3’
seq ID No.3:5’FAM- TGCCATCATAAAGGCCGGTG -3’BHQ-1
seq ID No.4:5’- AACTGTTCGCCAGGCTCAAG -3’
seq ID No.5:5’- AAGCGGCCATTTTCCACCAT -3’
seq ID No.6:5’VIC- TCGTGACCCATGGCGATGCCTGCTT -3’BHQ-2
所述阳性质控标准品由耐药菌株调整比浊度,其菌含量约为1.5×105 CFU/mL,经80℃热灭活60 min;
所述阴性质控标准品由灭菌双蒸水。
2.权利要求1所述的一种检测布鲁氏菌阿米卡星耐药性RT-PCR试剂盒的非疾病诊断治疗目的的使用方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取待测样本的基因组DNA,经核酸浓度检测仪Nanodrop检测浓度高于1ng/μL;(2)以提取的样本基因组DNA为模板,将A液和B液按比例混合,再加入模板,同时进行阳性质控标准品、阴性质控标准品对照,进行荧光定量检测;荧光定量检测仪以LightCycler 480仪器为例;至少三个测试样品:一个A液+B液+待测试提取的DNA模板,一个A液+B液+阳性质控标准品,一个A液+B液+阴性质控标准品;
上述三个测试样品的PCR扩增体系为25μL/样品,具体包括:15 μL A液,7 μL B液,3 μL待测试提取的DNA模板或阳性质控标准品或阴性质控标准品;
两步法进行RT-PCR,荧光定量扩增程序为:95℃ 30 s,95℃ 5 s、60℃ 30 s,40个循环;
(3)结果判定:其中步骤(2)阳性质控标准品对应的样品的FAM和VIC信号均存在扩增曲线,CT值在32-35之间,步骤(2)阴性质控标准品对应的样品的FAM和VIC信号不存在扩增曲线,则试验成功;否则试验失败,需重做;
(4)步骤(3)试验成功后,对应的待测试提取的DNA模板的样品的FAM和VIC信号:待测试提取的DNA模板的FAM信号存在扩增曲线,而VIC信号不存在扩增曲线,则待测样品为布鲁氏菌但不存在阿米卡星耐药性;FAM信号存在扩增曲线,且VIC信号存在扩增曲线,则待测样品为布鲁氏菌且存在阿米卡星耐药性;FAM信号不存在扩增曲线,且VIC信号不存在扩增曲线,则待测样品为非布鲁氏菌且无阿米卡星耐药性。
3.按照权利可要求2所述的方法,其特征在于,步骤(1)所述待测样本选自血液、血清、奶样、组织样本、气溶胶样本任意一种。
4.按照权利可要求2所述的方法,其特征在于,最低检测菌含量为102 CFU/μL。
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