[发明专利]一种与白菜花色性状相关的SNP分子标记及其检测引物、检测试剂盒和应用

说明书

本发明提供了一种与白菜花色性状相关的SNP分子标记及其检测引物、检测试剂盒和应用，属于作物分子标记辅助育种技术领域。与白菜花色性状相关的SNP分子标记位于如SEQ ID NO：1所示基因片段第101位，第101位碱基为G/‑，该位点为G时白菜花色为黄花，该位点缺失时白菜花色为白花。基于KASP技术检测白菜花色用引物包括一条反向引物和两条5'端序列为标记有FAM或HEX荧光基团的标签序列的正向引物。鉴于该SNP分子标记及其引物能够准确鉴定白菜花色性状，因此本发明提供了SNP分子标记、引物或试剂盒在检测白菜花色或白菜植物育种中的应用，不受环境因素限制，能大幅度降低工作量，有助于加快大白菜育种。

技术领域

本发明属于作物分子标记辅助育种技术领域，具体涉及一种与白菜花色性状相关的SNP分子标记及其检测引物、检测试剂盒和应用。

背景技术

花色是植物适应环境的表型性状之一，是虫媒植物引诱昆虫进行授粉的一个重要视觉信号，对植物生存繁衍具有重要意义。同时花色可以影响蚜虫取食，生产中选育不同花色的作物品种具有降低蚜虫传病的作用，可以维持花瓣的能量平衡，避免花器官受伤害。在生产实践中花色可用于鉴别真假杂交种。

大白菜是我国栽培面积和产量最大的蔬菜作物之一，具有重要的经济价值。芸薹属中，白花性状在甘蓝型油菜、芥菜型油菜的研究较多，在白菜中的研究较少。目前尚没有用于鉴定白菜白花性状相关的分子标记的报道。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一种与白菜花色性状相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记能准确区分白菜中黄花花色和白花花色表型。

本发明的目的还在于提供一种用于鉴定白菜花色性状的检测引物、检测试剂盒和应用。

本发明提供了一种与白菜花色性状相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记位于如SEQ ID NO：1所示的基因片段的第101位，第101位碱基为G/-，其中-表示缺失。

本发明提供了一种基于竞争性等位基因特异性PCR技术检测白菜花色用引物，包括TXBH83Fa、TXBH83Fb和TXBH83R；

所述TXBH83Fa的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示；

所述TXBH83Fb的核苷酸序列如SEQ ID NO：3所示；

所述TXBH83R的核苷酸序列如SEQ ID NO：4所示；

其中所述TXBH83Fa或TXBH83Fb的5'端序列为标记有FAM或HEX荧光基团的标签序列。

本发明提供了一种基于竞争性等位基因特异性PCR技术检测白菜花色用试剂盒，包括所述引物。

优选的，所述试剂盒还包括KASP Master mix。

本发明提供了所述SNP分子标记、所述引物或所述试剂盒在检测白菜花色或检测白菜花色基因型中的应用。

本发明提供了所述SNP分子标记、所述引物或所述试剂盒在白菜植物育种中的应用。

本发明提供了一种高通量检测白菜花色的方法，包括以下步骤：

1)提取待检测花色的白菜基因组DNA；

2)以步骤1)中基因组DNA为模板，用所述引物进行竞争性等位基因特异性PCR扩增，得到KASP扩增产物；

3)将所述KASP扩增产物进行终点法荧光信号读取，得到基因分型结果；

由引物TXBH83Fa和TXBH83R扩增得到的基因型片段来自于具有黄花性状的白菜；

由引物TXBH83Fb和TXBH83R扩增得到的基因型片段来自于具有白花性状的白菜。