[发明专利]用于大凉螈亲子鉴定及种群遗传分析的SSR荧光标记引物

说明书

本发明属于遗传学领域，具体涉及用于大凉螈亲子鉴定及种群遗传分析的SSR荧光标记引物。具体技术方案为：一组可进行大凉螈个体识别、亲子鉴定、种群遗传结构分析的方法和10对微卫星引物。本发明提供的位点(引物)兼具准确性和多态性。将本发明提供的技术用于种群性选择研究和种群遗传分析，可从繁殖、遗传分化等角度提出科学可行的保护建议，为未来保育工作奠定基础。

技术领域

本发明属于遗传学领域，具体涉及用于大凉螈亲子鉴定及种群遗传分析的SSR荧光标记引物。

背景技术

大凉螈(Liangshantriton taliangensis)隶属于蝾螈科(Salamandridae),有尾目(Caudata)，是我国特有种，属国家二级重点保护野生动物。原隶属于疣螈属(Tylototriton)，费梁(2012)根据其头骨形态特征，将其从疣螈属中划分出来，独立成凉螈属(Liangshantriton)。

大凉螈具有分布区狭窄、迁移能力弱、繁殖潜力较低等生理及生活史特征，使得其面对环境变化时非常敏感，种群下降后恢复缓慢。目前，由于栖息地丧失，外来物种入侵，过度利用等生态问题，大凉螈正经历着种群持续下降，急需开展相关保育工作，然而该物种的种群遗传结构，地理格局等生物信息作为保护工作的重要基础目前处于缺失状态，因此开发合适的遗传标记是首要工作。此外，该物种具有典型的性二型特征，体内纳精的精子交接模式及雄性竞争行为，是研究有尾两栖类精子竞争的理想模型，应用亲子鉴定技术更深入的研究其性选择过程，有助于预测种群的发展规律，可切实推动我国大凉螈种群保护实践工作。

微卫星标记被称为第二代分子标记，其在每个真核生物基因组中大量出现，由DNA的串联重复单位组成，通常长度小于5个碱基(1～6个碱基)，又称为串联重复序列(Shorttandem repeat,STR)或简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)。微卫星基因座多态性来自于串联重复序列数量在不同个体基因组中的变化，其遗传方式同样遵循孟德尔遗传定律，并具有共显性。此外，由于微卫星位点的侧翼序列具有保守性，因此这些位点常常还可以进行跨种扩增，这对于近缘物种的保护遗传学研究具有重要意义。

目前还没有微卫星标记用于大凉螈亲子鉴定、种群结构分析及遗传管理的相关报道。

发明内容

本发明的目的是提供一组用于大凉螈亲子鉴定及种群遗传分析的SSR荧光标记引物。

为实现上述发明目的，本发明所采用的技术方案是：一组引物对，包括引物对DLY181，正向序列和反向序列分别如SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.16所示；包括引物对DLY39，正向序列和反向序列分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示。

相应的，一组引物对，包括引物对DLY181，正向序列和反向序列分别如SEQ IDNO.15、SEQ ID NO.16所示；包括引物对DLY39，正向序列和反向序列分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示，包括引物对DLY124，正向序列和反向序列分别如SEQ ID NO.3、SEQ IDNO.4所示。

相应的，一组引物对，包括引物对DLY181，正向序列和反向序列分别如SEQ IDNO.15、SEQ ID NO.16所示；包括引物对DLY39，正向序列和反向序列分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示，包括引物对DLY124，正向序列和反向序列分别如SEQ ID NO.3、SEQ IDNO.4所示，包括引物对DLY173，正向序列和反向序列分别如SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.14所示。