[发明专利]一种用于检测白叶枯病抗性基因Xa23的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.SNP分子标记在辅助鉴定水稻白叶枯病抗性基因Xa23中的应用；所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO .1所示，所述SNP分子标记多态性位于序列的第51位点处碱基为A/G。

2.引物或含有所述引物的试剂盒在检测水稻白叶枯病抗性基因Xa23中的应用；所述引物的序列如下所示：

特异性引物：

Primer X：5’-AATAAATATGGCCAAGACATAAGACAG-3’(SEQ ID NO .2)；

Primer Y：5’-AATAAATATGGCCAAGACATAAGACAA-3’(SEQ ID NO .3)；

通用引物：

Primer C：5’-CCTTGCTCCCCTGGTCTAA-3’(SEQ ID NO .4)。

3.一种检测白叶枯病抗性基因Xa23基因型的方法，其特征在于，包括如下步骤：

S1：采用引物或含有所述引物的试剂盒对水稻样品基因组进行KASP反应检测；其中，两条特异性引物分别连接不同的荧光序列；

S2：若只检测到引物Primer Y所连荧光序列对应的荧光信号，则判断水稻样品为具有白叶枯病抗性的纯合Xa23基因型；若只检测到引物Primer X所连荧光序列对应的荧光信号，则判断水稻样品为不具有白叶枯病抗性的纯合Xa23基因型；若同时检测到两种荧光，则判断水稻样品为不具有白叶枯病抗性的杂合Xa23基因型；

所述引物的序列如下所示：

特异性引物：

Primer X：5’-AATAAATATGGCCAAGACATAAGACAG-3’(SEQ ID NO .2)；

Primer Y：5’-AATAAATATGGCCAAGACATAAGACAA-3’(SEQ ID NO .3)；

通用引物：

Primer C：5’-CCTTGCTCCCCTGGTCTAA-3’(SEQ ID NO .4)。

4.与水稻白叶枯病抗性基因Xa23紧密连锁的SNP分子标记或扩增所述SNP分子标记的引物或含有所述引物的试剂盒在水稻抗病性辅助育种中的应用；所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO .1所示，所述SNP分子标记多态性位于序列的第51位点处碱基为A/G；

所述引物的序列如下所示：

特异性引物：

Primer X：5’-AATAAATATGGCCAAGACATAAGACAG-3’(SEQ ID NO .2)；

Primer Y：5’-AATAAATATGGCCAAGACATAAGACAA-3’(SEQ ID NO .3)；

通用引物：

Primer C：5’-CCTTGCTCCCCTGGTCTAA-3’(SEQ ID NO .4)。

5.与水稻白叶枯病抗性基因Xa23紧密连锁的SNP分子标记或扩增所述SNP分子标记的引物或含有所述引物的试剂盒在水稻种质资源改良中的应用；所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO .1所示，所述SNP分子标记多态性位于序列的第51位点处碱基为A/G；

所述引物的序列如下所示：

特异性引物：

Primer X：5’-AATAAATATGGCCAAGACATAAGACAG-3’(SEQ ID NO .2)；

Primer Y：5’-AATAAATATGGCCAAGACATAAGACAA-3’(SEQ ID NO .3)；

通用引物：

Primer C：5’-CCTTGCTCCCCTGGTCTAA-3’(SEQ ID NO .4)。

6.与水稻白叶枯病抗性基因Xa23紧密连锁的SNP分子标记或扩增所述SNP分子标记的引物或含有所述引物的试剂盒在培育具有白叶枯抗病能力的水稻中的应用；所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO .1所示，所述SNP分子标记多态性位于序列的第51位点处碱基为A/G；

所述引物的序列如下所示：

特异性引物：

Primer X：5’-AATAAATATGGCCAAGACATAAGACAG-3’(SEQ ID NO .2)；

Primer Y：5’-AATAAATATGGCCAAGACATAAGACAA-3’(SEQ ID NO .3)；

通用引物：

Primer C：5’-CCTTGCTCCCCTGGTCTAA-3’(SEQ ID NO .4)。